В 1853 году в Оренбурге появилось здание одного из самых красивых храмов, посвящённое Покрову Пресвятой Богородицы. Церковь расположена в районе города, известном как старая или голубиная Слободка. Решение о строительстве храма было принято после эпидемии холеры в 1848 году. Семья почетного гражданина и купца первой гильдии Михаила Стефановича Деева чудом избежала болезни. В знак благодарности Богу он обратился к военному губернатору В.А. Обручеву с просьбой разрешить строительство храма в слободе.

Закладка храма состоялась 30 апреля 1852 года. Изначально у храма был один престол, посвящённый Покрову Пресвятой Богородицы. В 1857 году к Покровской церкви были пристроены и освящены два придела: во имя Архангела Михаила и Сергия Радонежского.

В 1930-х годах храм был закрыт и лишён куполов, а в его здании разместились столярный и мебельный цеха, а также другие производства. В 1991 году здание вернули верующим, и начались работы по восстановлению храма. 23 февраля 1992 года было проведено малое освящение правого придела во имя Архангела Михаила. Благодаря усилиям прихожан, благотворителей и настоятеля храма, к 160-летию его освящения 8 декабря 2013 года центральный престол в честь Покрова Пресвятой Богородицы был вновь освящён.