Церковь в селе, вероятно, столь же стара, как и само поселение. Уже в 1500 году она существовала, поскольку иначе Борисово не называлось бы селом. В книге А. Федорова «Историческое собрание о гражданах Суздаля» упоминается, что село Борисово было самостоятельным приходом Суздальской епархии. Согласно местным церковным документам, церковь была посвящена святому и чудотворцу Николаю и называлась Никольской. Она была деревянной, с деревянной колокольней. Эта церковь просуществовала до 1800 года, когда была построена и освящена новая каменная церковь с одним престолом в честь святого и чудотворца Николая. Колокольня при новой церкви также была каменной.