Каменная церковь в селе Елизарьеве была построена в 1820 году благодаря заботам графини С. А. Толстой и ее дочери, в замужестве Закревской. В «Летописи Серафимо-Дивеевского монастыря» упоминается, что графиня посетила общину при Казанской церкви в Дивееве и, сочувствуя их бедственному положению, подарила им небольшой участок своей земли. Однопрестольная церковь была украшена росписями, выполненными учениками художественной школы Ступина. Эти росписи уникальны как по технике исполнения, так и по библейским сюжетам.

К храму, как и прежде, ведут две дороги: одна из Арзамаса на Дивеево и Саров, другая, со стороны Арзамаса через села Ореховец, Онучино, Березино, Ивановское и Круглые Паны. С холма у села Круглые Паны Никольская церковь в Елизарьеве особенно заметна, вызывая радость у паломников.

В 1930-х годах церковь в Елизарьеве была закрыта, и настоятеля, отца Иакова, неоднократно арестовывали. 20 ноября 1937 года его задержали прямо в храме и, не позволив вернуться домой, отправили в арзамасскую тюрьму. В тот же день в Горьком был расстрелян его младший брат, протоиерей Михаил, который в 2001 году был включен в Собор новомучеников и исповедников Российских. Через четыре дня, 24 ноября, было подписано обвинительное заключение, и дело передали на рассмотрение тройки при УНКВД по Горьковской области. 2 декабря был вынесен приговор: расстрелять и конфисковать имущество. В протоколе указано, что отец Иаков был расстрелян в Горьком 26 декабря 1937 года.

30 июля 2003 года на заседании Священного синода Русской Православной Церкви имя священномученика Иакова Гусева было включено в Собор новомучеников и исповедников Российских XX века от Нижегородской епархии.

С 1991 года Никольская церковь в Елизарьеве вновь открыта для прихожан. Начался долгий процесс реставрации, который продолжается и сегодня. 10 февраля 2006 года архиепископ Нижегородский и Арзамасский Георгий совершил чин освящения храма.