Село Черняное было основано не позднее 1740 года и получило свое название от слова "чернь", означающего чернолесье. В 1782 году здесь был создан православный приход. В 1884 году в селе построили новую деревянную церковь в честь Святителя Николая с приделами Благовещения Пресвятой Богородицы и апостола Иоанна Богослова, средства на которую собрали прихожане. При церкви работала церковно-приходская школа. В советский период храм был осквернен и разрушен, а на его месте возвели школу.

В 1997 году администрация села передала здание дома быта, построенного в 1968 году, для нужд церкви. В 1998 году здание было реконструировано: к нему добавили алтарную апсиду, трапезную, притвор и котельную, а над основным объемом установили главку на граненом декоративном барабане. С 1998 года Никольская церковь вновь действует, в ней регулярно проводятся Богослужения.