Первая церковь в Благодаровке была возведена в 1857 году на средства прихожан. В 1903 году она сгорела в результате пожара. Уже в 1904 году жители построили новую церковь. В 1867 году при церкви начало работу церковно-приходское училище. В 1930 году церковь закрыли, и её дальнейшая судьба остаётся неизвестной.

В 2002 году на месте бывшего дома священника началось строительство нового храма.