Село было основано в конце XVI века. В 1872 году в Алкужинских Борках прихожане построили деревянную однопрестольную Воскресенскую церковь, которая была приписана к церкви Воскресения Словущего в селе Серповом. Это, вероятно, была не первая церковь в селе, так как приходу уже было около 200 лет. В 1890-х годах деревянная церковь сгорела, и на средства прихожан началось строительство новой однопрестольной тёплой каменной церкви, завершённое в 1903 году. В том же году церковь освятили во имя Николая Чудотворца. Значительную часть расходов на строительство взял на себя местный житель И.Г. Никонов. В церкви служили священник, дьякон и псаломщик.

В селе также действовала одноклассная церковно-приходская школа и церковно-приходское попечительство. В 1911 году в селе насчитывалось 320 дворов и проживало 1145 мужчин и 1138 женщин. В обществе трезвости состояло 26 человек.

В 1934 году церковь пострадала от пожара, а в 1935 году её закрыли, и здание стали использовать как склад. Внутри сохранились фрагменты фресок и каркас иконостаса.

Церковь имеет традиционную планировку "кораблем", симметричную по оси запад-восток. Основной объём в виде двухъярусного четверика был увенчан пятиглавием над четырёхскатной кровлей. К четверику с севера и юга примыкают одноярусные притворы с небольшими главками, а с востока, полукруглая апсида. Высокая трёхъярусная шатровая колокольня соединена с храмом одноэтажной трапезной. Фасады выполнены в стиле ретроспективизма, популярного в конце XIX века, который воспроизводил формы московского "узорочья" XVII века. Возможно, проект церкви разработал епархиальный архитектор Владимир Иванович Фрейман, который в это же время построил каменную церковь Воскресения Словущего в соседнем селе Серповом.

В настоящее время церковь признана памятником регионального значения, но это никак не отражается на её состоянии.