В сентябре 1876 года настоятелем обители стал иеромонах Иосиф. Он решил перестроить и расширить обветшавший Свято-Никольский храм, который был возведён в третьей четверти XVIII века при иеромонахе Клеопе. Через полгода после назначения Иосиф представил Архиепископу Антонию во Владимир проект строительства тёплого храма. После замечаний и наставлений Владыки было решено удлинить храм с восточной стороны на 8 аршин, снять старый верх, повысить здание, добавив 3-4 аршина к стенам, убрать внутреннюю стену и столбы, установить лёгкий, но прочный шатровидный свод, увенчать его позолоченными главой и крестом, расширить и удлинить оконные рамы, заново выстлать полы, поставить новый иконостас в главном храме, а придельный алтарь перенести на хоры, пустив туда свет из окон второго яруса, заменить расшатавшиеся престолы новыми. Лесной материал разрешили использовать из монастырской дачи. С наступлением благоприятной погоды началась разборка старого здания и подвоз стройматериалов. Среди жертвователей на реконструкцию были промышленники Морозовы.

Одной из главных святынь монастыря, хранившихся в соборе, была часть древа Креста Господня с частицами мощей святых, преимущественно подвижников Афонских монастырей, все частицы были вложены в киот с серебряным вызолоченным крестом в центре. После закрытия монастыря в Никольском храме, как приходском, ещё некоторое время проводились службы. 13 августа 1926 года начальник 1 уездной милиции Ерёмин сообщил в Административный отдел Моссовета, что церкви в бывшем Введено-Островном монастыре больше нет, группа верующих была ликвидирована в 1924 году, и монастырь до 1 мая этого года использовался как дом инвалидов, а с 1 мая стал детской колонией. Вся монастырская собственность была перевезена в соседний город Покров, и началась перестройка здания. С церкви сняли купол с крестом, со стен убрали все иконы, а стены замазали штукатуркой, иконостас разобрали на дрова. Никольский храм с заложенными окнами подвергся внутренней перепланировке и был превращён в клуб. Почти ничто не напоминало о том, что когда-то в бывшей церкви проходили богослужения и теплилась духовная жизнь.

В 1995 году храм во имя Николая Чудотворца был восстановлен. Настоятельница Свято-Введенской обители матушка Феврония вспоминала, что стены были покрыты штукатуркой, которая плохо держалась. Перед очередной побелкой решили смыть все слои штукатурки и с удивлением обнаружили под ней старинные росписи и лики удивительной красоты. Были приглашены реставраторы, и под руководством художника В.И. Некрасова, следуя древним образцам, они метр за метром восстанавливали, казалось бы, навсегда утраченные святые образы. Для Никольского храма изготовили новый иконостас и заказали иконы. Изящные деревянные киоты для икон, панихидный столик и многое другое были созданы замечательными художниками из мастерской резьбы по дереву во Владимире. В Свято-Никольской церкви в ковчеге хранятся мощи старца Клеопы, недавно обретённые при ремонтных работах во Введенском храме.