Каменный храм, возведённый в 1877 году святителем Игнатием Брянчаниновым, заменил старую Иверскую церковь. В конце 1920-х и в середине 1930-х годов его начали разбирать на кирпичи для строительства бани в поселке Красный Профинтерн. Однако стены храма оказались настолько прочными, что дальнейшая разборка стала невозможной, и было принято решение его взорвать. Летом 1940 года в монастырь прибыла специальная бригада взрывников, которая заложила взрывчатку в отверстия, просверленные в стенах храма Иверской Божьей Матери, и произвела его уничтожение. Главный купол храма оказался в нижней подвальной части.

На месте разрушенного храма был построен новый Иверский храм. В марте 2014 года митрополит Ярославский и Ростовский Пантелеимон впервые отслужил в нём Божественную литургию. 17 мая владыка провёл чин великого освящения и снова отслужил Божественную литургию в освящённом храме.

В период с 2009 по 2014 годы была возведена новая четырёхстолпная одноглавая одноапсидная церковь, которая повторяет формы новгородского храма Феодора Стратилата на Ручью. Великое освящение состоялось 17 мая 2014 года.