В 1687 году по заказу архимандрита Богословского монастыря Герасима был построен храм в честь Иоанна Богослова, который освятил ростовский митрополит Ион III Сысоевич. В начале XVII века церковь и село вокруг нее были уничтожены огнем. Новую церковь возвели лишь в 1680-е годы. Богословский храм оставался действующим до прихода советской власти, его величественный вид и красота привлекали художников. Известный русский живописец В. В. Верещагин изобразил его на картине «Паперть сельской церкви. В ожидании исповеди».

В 1913 году храм посетил государь Николай II с семьей в честь празднования 300-летия династии Романовых. Сохранились цветные фотографии церкви и ее иконостаса, сделанные в 1911 году фотографом С.М. Прокудиным-Горским.

Храм Иоанна Богослова представляет собой ярусную деревянную церковь, установленную на высокий подклет. В его декоре много рубленных и резных элементов: коньки на крыше, потолки из тонких досок, уложенных «в елочку», и изящные резные колонны. Над и под окнами расположены декоративные резные доски, а оконные проемы закрываются деревянными ставнями особой конструкции.

Колокольня была построена в XIX веке и соединена с храмом деревянным переходом. Внутри Богословская церковь светлая и просторная, поражает богатством убранства. В алтарной части находятся фрагменты старинного тяблового четырехуровневого иконостаса с яркой орнаментальной росписью. Иконы в нем датируются XVI-XVIII веками. Рядом установлена копия уникальных деревянных Царских врат, созданных в 1562 году мастером-резчиком монахом Исайей. Ростовский мастер В.Л. Никольский вырезал эту копию в 1880-е годы.

Сейчас храм не действует и находится под управлением музея-заповедника Ростовского кремля. Церковь охраняется как памятник древнерусской деревянной архитектуры.