На южной стороне монастырского двора расположена Знаменская церковь. Эта трапезная церковь, посвященная Иконе Божией Матери «Знамение», была возведена в 1625 году и восстановлена в 1963 году под руководством А.Д. Варганова.

Церковь имеет характерную для XVII века планировку и конструкцию. Это невысокое и простое здание с просторной трапезной палатой. Оно двухэтажное, с обширным квадратным залом в западной части, который поддерживается одним столбом. Нижний этаж использовался для хозяйственных нужд, а его планировка повторяется на верхнем этаже. К трапезной палате с востока примыкает узкое помещение церкви, соединенное с палатой большой аркой и двумя широкими окнами, за которыми находится алтарь.

Интерьер впечатляет своей простотой и величественностью. С западной стороны к трапезной примыкает келарская палата, выступающая во двор монастыря. Архитектор уделил особое внимание парадной стороне, разместив в центре фасада палаты входной портал, к которому ведет каменная лестница. Фасады, обращенные к хозяйственной части монастыря, оформлены менее выразительно. Апсиды образуют широкую криволинейную плоскость, а оконные наличники с треугольными завершениями выглядят наивно, входя в скромный карниз. Верх здания был изменен в более позднее время.

Этот обширный комплекс соединен переходом с каменными архимандритским и братским корпусами, построенными в 1763 году.