Село Пересыпкино Первое впервые упоминается в окладных книгах 1702 года, где говорится о часовне Богоявления Господня в сельце Пересыпкино-Коварское. Со временем село разрасталось, и в 1765 году в нем появилась деревянная церковь простой архитектуры, которую перестраивали в 1843 и 1895 годах. В храме Богоявления Господня с приделами в честь Казанской иконы Божией Матери и Михаила Архангела действовали церковно-приходская школа и попечительство. В 1930-х годах храм был закрыт, но в 1947 году богослужения в нем возобновились. В 1962 году его снова закрыли. В разные периоды в здании храма размещались склад зерна и сельский клуб.

С 19 ноября 1989 года в селе вновь действует приход. 22 октября 2011 года епископ Тамбовский и Мичуринский Феодосий совершил чин освящения нового просторного деревянного храма в честь Богоявления Господня.