В 12 верстах от Феодоровского монастыря в Переславле, вдоль Московско-Ярославского шоссе в сторону Сергиева Посада, в двух с половиной верстах на восток от села Выползова Слобода, была основана Алексеевская пустынь. Её устроительницей, как и Всехсвятской пустыни при станции Берендеево и Воскресенской пустыни в селе Новоселье, стала игуменья Феодоровского монастыря Евгения. Она активно участвовала в приобретении земли и указывала, что и как строить. Также она привлекала благотворителей, в основном московских купцов, к поддержке Феодоровского монастыря и его «удалённых офисов».

Землю для Алексеевской пустыни приобрели на пожертвования московского купца Василия Глинского. Церковь во имя Алексея человека Божиего и колокольню при ней построили на средства жены московского купца Анны Афанасьевны Анукиной.

Закладка Алексеевской церкви прошла 8 июля 1889 года, а освящение состоялось 28 июля 1891 года архиепископом Владимирским Феогностом. Церковь была оснащена иконами высокого качества, утварью, облачениями и богослужебными книгами. Отопление в храме было духовое. Пустынь обнесли каменной оградой. Внутри построили двухэтажный деревянный корпус для монашествующих, каменный двухэтажный корпус для монахинь и послушниц, а также каменный скотный двор. Имелся также деревянный дом, где в одной половине жили послушницы, а в другой размещалась церковно-приходская школа для мальчиков и девочек.

При пустыни состоял священник для проведения богослужений. Для него за оградой построили деревянный дом с хозяйственными постройками. Кроме обеспечения продовольствием, священнику назначались проценты с капитала в 10 000 рублей.

В 1920-х годах пустынь была закрыта и разорена. К 1980-м годам от каменной трапезной оставалась лишь часть стен, а от келейного корпуса, голые стены.

В 1991 году Алексеевский храм вернули верующим. Под руководством священника Алексея Василенко проведены восстановительные работы: построен крестильный храм, в восстановленном келейном корпусе открыта приходская школа с музеем и библиотекой. Временную деревянную звонницу заменила восстановленная колокольня.