Часовня входит в состав мемориального комплекса, посвященного памяти мирных жителей России, погибших в годы Великой Отечественной войны. 25 октября 1941 года в деревне Хацунь оккупанты расстреляли 318 человек, среди которых были местные жители, жители соседних деревень и беженцы из оккупированного Брянска.

Осенью 1941 года на Брянщине фашисты атаковали советские военные подразделения, а красноармейцы укрывались в густых брянских лесах.

24 октября 1941 года в деревне Хацунь Карачевского района несколько красноармейцев, пытавшихся выйти из окружения, напали на трех фашистов и освободили шестерых военнопленных. Двое немцев погибли, а третий, раненый, сумел скрыться в лесу.

В то время в фашистских войсках действовал приказ: за каждого убитого немецкого солдата казнить сто местных жителей. Утром 25 октября три отряда карателей собрали всех жителей деревни. Некоторых казнили с особой жестокостью, остальных расстреляли, а деревню сожгли. В результате Хацунской трагедии погибло 318 человек, включая малолетних детей.

Хацунь стала одной из первых жертв немецкого геноцида на русской земле. Ее судьбу повторили 12 населенных пунктов Брянской области, и в целом за годы оккупации на Брянщине были уничтожены более тысячи деревень.