На Мытном дворе взимали пошлину за скот, пригнанный в Москву для продажи, и это название перешло на соседнюю улицу, Мытная. До наших дней сохранились три здания Мытного двора на 3-м Люсиновском переулке: главный корпус, западный и восточный флигели, построенные в 1803-1804 годах архитектором Ф.К. Соколовым. Существует информация, что юго-западный флигель, выполнявший роль сторожки, был возведен в 1812-1816 годах. Главный корпус представляет собой образец застройки парадной зоны двора. В 1898 году здание подверглось капитальному ремонту: его приспособили под трактир, добавили пристройку для лестницы и полностью перепланировали. В 1906 году провели центральное отопление, очередную перепланировку, а также обустроили погреба и сараи. В советское время исторические интерьеры и парадная лестница были утрачены.

Западный флигель был перестроен в 1980-х годах, что привело к утрате его первоначальной планировки: перекрытия заменили на железобетонные, сделали плоскую крышу и новые лестницы.

В последние годы территорию Мытного двора занимал 32-й автокомбинат. С 2007 года на большей части территории началось строительство жилого комплекса.

В ходе реставрации 2004 и 2006 годов главный корпус и западный флигель были восстановлены в их первоначальном виде. Западному флигелю вернули двускатную крышу и декоративное оформление фасадов. Восточный флигель, находящийся на территории строительства, ожидает своей реставрации.