Les portes secrètes sont situées au nord du clocher de la cathédrale Sainte-Sophie dans le mur du Kremlin, dans l'un de ses sections les plus basses. Cette partie de l'ancienne forteresse reste mystérieuse et peu étudiée. La maçonnerie inhabituelle en pierre calcaire au-dessus des portes, du côté extérieur du Kremlin, suscite des hypothèses sur une construction antérieure à la fin du XVe siècle. A.V. Vorobiov et S.N. Orlov ont suggéré qu'il pourrait y avoir eu une treizième tour de tir, mais N.N. Kouzimna et L.A. Philippova ne sont pas d'accord. Les sources écrites des XVIe et XVIIe siècles indiquent la présence uniquement de portes d'eau, et les fouilles archéologiques menées par S.V. Troïanovski en 1995 n'ont révélé aucune trace de tour.

Les portes secrètes sont un passage en arc de 430 cm de large avec deux saillies latérales. La maçonnerie au-dessus des portes, du côté de la rivière, est faite de calcaire gris et brun et est limitée par une ligne droite. Les recherches de 1994 ont montré que la chaussée des portes, recouverte d'arcs et de voûtes, a été construite à la fin du XIXe, début du XXe siècle. Au-dessus des portes se trouve une vaste chambre voûtée de 7x3 m, qui a été mise à jour après l'effondrement de la partie ouest du mur en 1911, mais a ensuite été scellée. En 1994, une autre chambre voûtée de 3,6 x 4 m a été découverte entre les portes et le clocher.

La comparaison des matériaux de construction et des techniques de maçonnerie montre que les deux chambres et la partie ancienne du clocher de 1439 appartiennent à une même période de construction, ce qui permet de supposer une construction antérieure de la partie du mur fortifié avec les portes, avant la fin du XVe siècle.

Actuellement, il n'y a pas d'ouvertures de fenêtres ou de portes dans les deux chambres, bien qu'elles aient existé au milieu du XVIIIe siècle. V.S. Peredolski les a vues à la fin du XIXe siècle, avant l'effondrement de la partie ouest du mur. La fonction de ces chambres est inconnue. A.L. Mongait, qui ne connaissait que la chambre supérieure, a supposé qu'un beau-frère du khan de Crimée y avait été emprisonné en 1551. Il est possible que les chambres aient été utilisées comme locaux de garde pour les arquebusiers, et que la chambre inférieure ait initialement abrité un puits secret.

En 1638, une forteresse en bois avec deux tours quadrangulaires a été construite près des portes d'eau et du secret. En 1660, le bourg a été restauré "selon l'ancienne structure" autour du puits, qui était couvert "de planches avec un auvent et autour du puits des garde-corps". Il est possible qu'après cela, le puits à l'intérieur du secret en pierre ait cessé d'exister. Au XVIIe siècle, une garde de cinq personnes se tenait dans les tours du Bourg Secret, ce qui souligne l'importance de ces portes pour le Detinets.

Auparavant, un cortège religieux passait par les portes d'eau pour se rendre à la rivière Volkhov afin de bénir les eaux de l'Yordanie.