Die geheimen Wasserpforten befinden sich nördlich des Glockenturms von St. Sophia in der Kremlmauer, an einem der niedrigsten Stellen. Dieser Abschnitt der alten Festung bleibt geheimnisvoll und wenig erforscht. Die ungewöhnliche Mauerwerksstruktur aus Kalkstein über den Toren auf der Außenseite des Kremls lässt vermuten, dass hier ein früherer Bau als das Ende des 15. Jahrhunderts existierte. A.V. Worobjow und S.N. Orlow vermuteten, dass hier der dreizehnte Turm-Raskat existiert haben könnte, aber N.N. Kusjmina und L.A. Philippowa stimmen dem nicht zu. Schriftliche Quellen aus dem 16. und 17. Jahrhundert weisen nur auf die Existenz der Wasserpforten hin, und archäologische Ausgrabungen, die 1995 von S.V. Trojanowski durchgeführt wurden, fanden keine Spuren eines Turms.

Die geheimen Pforten bestehen aus einem Bogenöffnung von 430 cm Breite mit zwei seitlichen Vorsprüngen. Das Mauerwerk über den Toren auf der Flussseite besteht aus grauem und braunem Kalkstein und ist durch eine gerade Linie begrenzt. Untersuchungen aus dem Jahr 1994 zeigten, dass die Fahrbahn der Pforten, die von Bögen und einem Gewölbe überdeckt ist, Ende des 19., Anfang des 20. Jahrhunderts erbaut wurde. Über den Toren befindet sich eine geräumige gewölbte Kammer von 7x3 m, die nach dem Einsturz des westlichen Teils der Mauer im Jahr 1911 freigelegt wurde, aber anschließend wieder zugemauert wurde. Im Jahr 1994 wurde zwischen den Toren und dem Glockenturm eine weitere gewölbte Kammer von 3,6 x 4 m entdeckt.

Der Vergleich der Baumaterialien und der Mauerwerkstechnik zeigt, dass beide Kammern und der alte Teil des Glockenturms von 1439 zu einem Bauzeitraum gehören, was die Annahme eines früheren Bauwerks des Abschnitts der Festungsmauer mit Toren als dem Ende des 15. Jahrhunderts zulässt.

Derzeit gibt es in beiden Kammern keine Fenster- und Türöffnungen, obwohl diese im mittleren 18. Jahrhundert existierten. W.S. Peredolsky sah sie Ende des 19. Jahrhunderts, vor dem Einsturz des westlichen Teils der Mauer. Der Zweck dieser Kammern ist unbekannt. A.L. Mongait, der nur von der oberen Kammer wusste, vermutete, dass dort 1551 der Schwager des Krimkhans gefangen gehalten wurde. Möglicherweise wurden die Kammern als Wachräume für Schützen genutzt, und in der unteren Kammer befand sich ursprünglich ein geheimer Brunnen.

Im Jahr 1638 wurde in der Nähe der Wasserpforten und des Geheimraums eine hölzerne Festung mit zwei quadratischen Türmen erbaut. Im Jahr 1660 wurde die Stadt „nach dem alten Muster“ um den Brunnen wiederhergestellt, der mit „Schindeln und einer Überdachung bedeckt und um den Brunnen mit einem Geländer versehen“ war. Möglicherweise hörte der Brunnen im Inneren des steinernen Geheimraums danach auf zu existieren. Im 17. Jahrhundert war in den Türmen des Geheimdorfes eine Wache von fünf Personen stationiert, was die Bedeutung dieser Pforten für den Detinets unterstreicht.

Früher führte der Kreuzgang durch die Wasserpforten zum Fluss Wolchow zur Weihe des Wassers der Jordan.