Le 13 mars 1719, l'archimandrite du monastère de Kirillo-Belozersky, Irinarkh, a consacré l'église au nom de la Transfiguration du Seigneur. À l'époque, tous les bâtiments du monastère, y compris la cathédrale, étaient en bois et souffraient souvent d'incendies. Un de ces incendies, survenu le 3 avril 1754 après la liturgie pascale, a détruit l'église et le clocher. Grâce aux contributions de l'impératrice Élisabeth Petrovna, la cathédrale a été restaurée d'ici 1756. Le temple avait cinq autels : le principal en l'honneur de la Transfiguration du Seigneur et quatre dans les chapelles. L'académicien Nikolaï Ozeretskovski, qui a visité le monastère en 1787, a noté que son emplacement était beau, mais que les constructions en bois ne correspondaient pas à cette grandeur.

Pour la renaissance du monastère, le métropolite Gabriel Petrov a invité le hiéromoine Nazaire Kondratiev du désert de Sarov. Le 7 mars 1782, Nazaire a été nommé constructeur du monastère de Valaam et élevé au rang d'igoumène. Il a élaboré un plan pour des constructions en pierre, qui a été approuvé le 10 février 1785. Pendant huit ans, avec l'aide de bienfaiteurs, tous les bâtiments du monastère ont été érigés. La cathédrale de la Transfiguration est devenue à deux étages, avec cinq dômes en forme d'oignon. L'église inférieure a été consacrée en 1789, et l'église supérieure, en 1794. Pour la première fois, un temple en l'honneur des fondateurs du monastère, Serge et Herman, est apparu à Valaam.

L'igoumène Nazaire a laissé le monastère en prospérité. Son successeur, le hiéromoine Innocent, a poursuivi l'embellissement de la communauté. En 1808, un contrat a été signé avec le peintre Alexeï Kozmine pour la décoration de la cathédrale. En 1823, le cercueil en bois a été remplacé par un cercueil en argent. En 1828, Elias Lennart, le créateur de l'épopée « Kalevala », a visité le monastère et a été impressionné par sa magnificence.

Au XIXe siècle, le monastère a atteint son apogée, surtout sous l'igoumène Damasquin. Valaam est devenu célèbre pour sa vie monastique stricte et ses anciens bénis. Avec l'ouverture de la navigation à vapeur avec Saint-Pétersbourg, le nombre de pèlerins a augmenté. En 1846, l'archimandrite Ignace Brianchaninov a proposé de construire une nouvelle grande cathédrale. En 1874, le professeur M.A. Chourupov a élaboré le projet d'une nouvelle cathédrale, mais il a été réalisé par un élève de l'igoumène Damasquin, l'igoumène Ionathan II, qui a commandé le projet à A.Y. Silin. La construction a commencé en 1887.

La construction de la cathédrale a rencontré des difficultés, mais après vérification des rumeurs de désordre, les travaux ont repris. Les architectes G.I. Karpov et N.D. Prokofiev ont apporté des modifications au projet. En 1892, le principal autel de l'église inférieure a été consacré, et en 1896, l'église supérieure. En 1940, après la guerre soviéto-finlandaise, le monastère est passé à l'URSS. Pendant la guerre, le monastère a été utilisé comme base militaire, et après la guerre, comme maison de retraite.

En 1971, la cathédrale a été placée sous la protection de l'État, mais à ce moment-là, elle avait déjà beaucoup souffert. En 1989, la renaissance de la vie monastique à Valaam a commencé. En 2002, le Conseil de bienfaisance patriarcal a été créé pour restaurer le monastère. En 2005, Sa Sainteté le Patriarche Alexis II a consacré la cathédrale de la Transfiguration.