El 13 de marzo de 1719, el archimandrita del monasterio de Kirillo-Belozersky, Irinarh, consagró la iglesia en nombre de la Transfiguración del Señor. En ese momento, todos los edificios del monasterio, incluida la catedral, eran de madera y a menudo sufrían de incendios. Uno de esos incendios, ocurrido el 3 de abril de 1754 después de la liturgia de Pascua, destruyó la iglesia y el campanario. Gracias a las contribuciones de la emperatriz Isabel Petrovna, la catedral fue restaurada para 1756. El templo tenía cinco altares: el principal en honor a la Transfiguración del Señor y cuatro en las capillas. El académico Nikolai Ozeretskoy, que visitó el monasterio en 1787, señaló que su ubicación era hermosa, pero los edificios de madera no correspondían a esta grandeza.

Para la revitalización del monasterio, el metropolitano Gabriel Petrov invitó al ieromonje Nazario Kondratiev del desierto de Sarov. El 7 de marzo de 1782, Nazario fue nombrado constructor del monasterio de Valaam y elevado al rango de igumen. Desarrolló un plan para edificios de piedra, que fue aprobado el 10 de febrero de 1785. Durante ocho años, con la ayuda de benefactores, se construyeron todos los edificios del monasterio. La catedral de la Transfiguración se convirtió en un edificio de dos pisos, con cinco cúpulas en forma de cebolla. La iglesia inferior fue consagrada en 1789, y la superior, en 1794. Por primera vez en Valaam apareció un templo en honor a los fundadores del monasterio, Sergio y Germán.

El igumen Nazario dejó el monasterio en prosperidad. Su sucesor, el ieromonje Inocencio, continuó embelleciendo la comunidad. En 1808, se firmó un contrato con el pintor Alexei Kozmin para la decoración de la catedral. En 1823, el sarcófago de madera fue reemplazado por uno de plata. En 1828, Elias Lennart, el creador de la epopeya 'Kalevala', visitó el monasterio y quedó impresionado por su grandeza.

En el siglo XIX, el monasterio alcanzó su apogeo, especialmente bajo el igumen Damasquino. Valaam se hizo conocido por su estricta vida monástica y sus ancianos benditos. Con la apertura del servicio de vapor a San Petersburgo, aumentó el número de peregrinos. En 1846, el archimandrita Ignacio Bryanchaninov propuso construir una nueva gran catedral. En 1874, el profesor M.A. Shchurupov desarrolló el proyecto de la nueva catedral, pero fue realizado por el alumno del igumen Damasquino, el igumen Ionafán II, quien encargó el proyecto a A.Ya. Silin. La construcción comenzó en 1887.

La construcción de la catedral enfrentó dificultades, pero después de verificar los rumores sobre desórdenes, el trabajo continuó. Los arquitectos G.I. Karpov y N.D. Prokofiev hicieron cambios en el proyecto. En 1892, se consagró el altar principal de la iglesia inferior, y en 1896, la iglesia superior. En 1940, después de la guerra soviético-finlandesa, el monasterio pasó a la URSS. Durante la guerra, el monasterio se utilizó como base militar, y después de la guerra, como hogar de internado.

En 1971, la catedral fue puesta bajo la protección del estado, pero para entonces ya había sufrido mucho. En 1989, comenzó la revitalización de la vida monástica en Valaam. En 2002, se formó el Consejo Patriarcal de Beneficencia para la restauración del monasterio. En 2005, el Santo Patriarca Alexis II consagró la catedral de la Transfiguración.