En 1882, le hiéromoine Josaph (Plekhano) a acquis un terrain à Jéricho, où, selon la tradition, se trouvait le figuier sous lequel le collecteur d'impôts Zachée a rencontré le Christ. Peu après, des vestiges d'un ancien temple ont été découverts à cet endroit. En 1886, Josaph a transféré ce terrain à la Société impériale orthodoxe de Palestine, qui a décidé de poursuivre les fouilles archéologiques.

Les fouilles ont été interrompues en 1914 en raison du début de la Première Guerre mondiale. Par la suite, le site a été sous l'administration du mandat britannique en Palestine, du royaume hachémite de Jordanie, d'Israël et de l'Autorité nationale palestinienne. Ce n'est qu'en 2008 que le terrain est finalement passé sous la gestion de la Société impériale orthodoxe de Palestine. En 2011, un centre muséal et parc a ouvert ses portes, où, en plus du musée, des clubs pour enfants et des cours de langue russe sont proposés.

Le musée russe à Jéricho a commencé ses activités au début de 2011. Le jardin oasis de Jéricho est situé sur la plaine du fleuve Jourdain. D'un point de vue archéologique, Jéricho représente une agglomération de monuments de différentes époques et types, formés ici depuis le mésolithique.

En 2010, Jéricho a célébré son dix-millénaire. Le nom de la ville provient du mot ancien « yareakh », signifiant « lunaire ». Dans la Bible, Jéricho est mentionnée comme la ville des palmiers, où l'abondance d'eau et la chaleur créaient des conditions idéales pour la culture de ce produit important des civilisations anciennes. Des sources d'eau douce et des pluies ont transformé la région en un oasis florissant, favorisant une colonisation précoce.

L'histoire du bâtiment en marbre à deux étages, où se trouve maintenant le musée, commence au XIXe siècle. En 1882, le hiéromoine Josaph est arrivé à Jéricho dans le but de créer un monastère russe pour les pèlerins. Le terrain a été acquis grâce aux fonds donnés par la bienfaitrice russe Elena Reznichenkova. L'endroit a été choisi en raison de l'arbre biblique, le figuier de Zachée. En 1884, Josaph a accidentellement découvert les ruines d'un ancien monastère et en a informé un membre du Conseil de la Société impériale orthodoxe de Palestine. En 1891, une expédition archéologique dirigée par le professeur Kondakov a déterminé que les ruines appartenaient à la période pré-byzantine.

Josaph a rapidement quitté la Palestine, transférant le terrain au vice-président de la Société impériale orthodoxe de Palestine. Le terrain a changé de mains plusieurs fois. Après la mort du président, le prince S. A. Romanov, des difficultés sont survenues pour transférer le terrain à l'IPPO ou au gouvernement russe. Le 9 juin 2008, une cérémonie de transfert du terrain à la propriété de la Fédération de Russie a eu lieu.

Quelques mois après la finalisation des documents, une délégation russe est arrivée à Jéricho. Les archéologues ont examiné les fouilles et confirmé leur potentiel. Peu après, la construction d'un complexe muséal a commencé, et un parc a été aménagé autour. Le 18 janvier 2011, le complexe muséal et parc à Jéricho a été solennellement inauguré.