Sur la petite île de Stolobny dans le lac Seliger, dans la région de Tver, à environ dix kilomètres d'Ostashkov, se trouve une célèbre attraction orthodoxe, le monastère masculin actif de la Désert de Nilo. Le monastère a été nommé en l'honneur de l'ermite Saint Nilo, né en 1485 dans le village de Zhabenskoe. En 1515, après avoir reçu la bénédiction de l'abbé, il s'est retiré dans le désert et s'est installé dans un endroit isolé près de la rivière Seremkhi dans la province de Rjev. Saint Nilo était constamment en veille et en prière, même pendant les courtes minutes de repos, il ne s'allongeait pas, mais se suspendait à des béquilles en bois enfoncées dans le mur. En 1528, il a fait le vœu de ne jamais s'asseoir ni se coucher.

La même année, Nilo a déménagé sur l'île de Stolobny dans le lac Seliger, à sept verstes d'Ostashkov. La première année, il a vécu dans une hutte creusée, puis il a construit une cellule et une chapelle pour prier. Saint Nilo a vécu sur l'île pendant 27 ans et avant sa mort, il a légué la construction d'un monastère à cet endroit, ce qui a été réalisé plus tard. En 1594, avec la permission du patriarche Job, une communauté monastique a été ouverte ici, marquant le début de l'histoire du monastère masculin de la Désert de Nilo-Stolobensky.

Avant la révolution de 1917, le monastère Nilo-Stolobensky était l'un des plus vénérés en Russie, attirant chaque année des milliers de pèlerins. En 1820, il a été visité par l'empereur Alexandre Ier. En 1919, toutes les valeurs ecclésiastiques ont été saisies et les reliques de Saint Nilo ont été ouvertes. Par la suite, l'ancien monastère a été utilisé comme colonie pour mineurs et camp pour prisonniers de guerre polonais.

En 1990, le complexe de la Désert de Nilo-Stolobensky a été transféré à l'Église orthodoxe russe. En 1995, les reliques de Saint Nilo ont été restituées au monastère.