Les derniers bâtiments du désert de Raïfa sont le clocher avec l'église de la porte en l'honneur de l'archange Michel et la cathédrale de la Trinité. La construction du clocher a commencé en 1889 grâce au financement et au contrat du célèbre bienfaiteur de Kazan, Mikhaïl Timofeïevitch Atlaschkin.

Selon la légende, la construction de la chapelle a été accompagnée d'un signe particulier de la faveur divine : l'un des moines a vu au-dessus du lieu de la future chapelle une main bénissante s'étendant d'un nuage lumineux. En même temps, d'autres entendaient le son des cloches, lié à la mort de Philaret, probablement en 1659, qui a été enterré au monastère de Spaso-Preobrazhensky. Pour obtenir la bénédiction pour la fondation du monastère, le moine Faddeï s'est adressé au prélat de Kazan au nom des moines. Le métropolite de Kazan et de Sviyazhsk, Lavrenti, a approuvé cette initiative et a envoyé aux ermites un hiéromoine expérimenté de Kazan, Savvatiy, pour établir la sainte communauté. En 1662, la première église en bois a été érigée au nom du saint évêque Euphyme, archevêque de Novgorod. En même temps, un mur avec deux églises de porte était en construction, dont l'une, dédiée aux saints Pères, tués au Sinaï et à Raïfa, a donné son nom au désert lui-même, le désert de Raïfa.