L'histoire du monastère féminin de Kazan commence à la forteresse de Tchebarkoul, où, à la fin des années 1830, une communauté monastique féminine s'est formée. Peu de temps après, une partie des sœurs a déménagé à Tcheliabinsk, fondant là le monastère d'Odigitrié. Les autres moniales se sont installées à Troitsk, où elles ont créé une communauté autonome, qui est devenue plus tard le monastère de Kazan. Pour sa construction, un promontoire à la périphérie ouest de la ville a été choisi.

Le monastère a été officiellement fondé en 1851. La communauté féminine de Troitsk a obtenu le statut de monastère "non statutaire" avec la permission de maintenir autant de moniales que la communauté pourrait soutenir sans aide gouvernementale. À la fin du XIXe siècle, le monastère était devenu l'un des plus riches de l'éparchie d'Orenbourg et un centre d'éducation. En 1897, l'une des premières écoles de Troitsk, l'école Nikolaïevska pour filles, a ouvert ses portes près du monastère. Il y avait également un hôpital, une pharmacie, un atelier de couture et un orphelinat. Le monastère était connu pour son atelier d'icônes, dont les icônes étaient utilisées pour récompenser les cosaques méritants.

Après la révolution, le monastère féminin de Kazan a cessé d'exister. Dans les archives de Troitsk, un document de 1927 indique que tous les bâtiments monastiques ont été transférés à des fins culturelles et éducatives par ordre du gouvernement central. Par la suite, le monastère a été presque complètement détruit, à l'exception de l'église de la Transfiguration du Seigneur, qui a survécu jusqu'à nos jours. La communauté a été rouverte en 1996, et depuis lors, la vie spirituelle a commencé à renaître.

Aujourd'hui, l'église de la Transfiguration du Seigneur, entourée de bâtiments modernes, y compris le collège d'aviation voisin, reste la plus haute structure de la ville et est bien visible même depuis des quartiers éloignés.