Au dix-neuvième siècle, Rostov-sur-le-Don est devenu l'une des villes les plus développées du sud de la Russie, ce qui a entraîné une augmentation du nombre de catholiques dans la ville. En conséquence, dans la seconde moitié de ce siècle, la première église catholique dédiée à « La Cène » a été construite à Rostov. En 1898, sa paroisse comptait environ 3000 personnes et continuait de croître.

À cette époque, diverses confessions chrétiennes coexistaient paisiblement dans la prospère Rostov-sur-le-Don, et personne ne pouvait imaginer que bientôt tous les chrétiens seraient soumis à de sévères persécutions. En 1920, les bolcheviks ont finalement pris la ville et ont commencé à modifier sa vie à leur guise, fermant et détruisant des temples. Parmi les bâtiments détruits se trouvait la belle église catholique.

Ce n'est qu'en 1992 que la paroisse de l'église détruite a été ressuscitée, et en octobre 1993, une chapelle en bois lui a été offerte. Au printemps 1999, les fondations d'une nouvelle église et d'un complexe spirituel et caritatif ont été posées, dont la construction s'est achevée en 2004. Le 19 septembre de la même année, la consécration solennelle du temple a eu lieu, présidée par l'évêque du diocèse de saint Clément à Saratov, Clément Pikkel. Peu après, le complexe spirituel et caritatif a commencé à fonctionner, offrant une vidéothèque, un salon musical et une salle informatique. La paroisse compte désormais plus de 300 personnes.