Le cimetière cosaque est apparu dans la partie est du faubourg cosaque au cours du troisième quart du XIXe siècle. Des parcelles ont été réservées pour les enterrements du corps des cadets, ainsi que pour les cimetières catholique et cholérique. Pendant la Grande Guerre patriotique, des soldats décédés dans les hôpitaux d'Omsk y ont été enterrés. Le cimetière était situé à la fin de la perspective Nikolsky (aujourd'hui rue des Aurores Rouges) derrière la rue Shkroevskaya (actuelle rue Kuybyshev).

Au départ, une chapelle a été construite au cimetière, et en 1859, au centre du cimetière, grâce aux fonds du maire d'Omsk Vladimir Petrovich Kuznetsov, une église en pierre a été érigée. Dans un ouvrage sur l'iconographie sibérienne du prêtre Alexander Sulotsky, il est mentionné que les icônes pour l'iconostase de l'église du cimetière, ainsi que pour les églises à Karkaral et Kuldzha, ont été commandées à Moscou par V.P. Kuznetsov. L'intérieur de l'église était décoré d'un chandelier en cristal, offert par V.P. Kuznetsov. En tant que maire, V.P. Kuznetsov a construit un nouveau pont Ilyinsky à travers l'Om, selon le projet d'E.I. Ezet. Il est décédé le 29 mars 1870. Le gouverneur général de la Sibérie occidentale A.P. Khrouchov a demandé la permission à l'archevêque de Sibérie et de Tobolsk d'enterrer V.P. Kuznetsov dans l'église du cimetière, mais l'archevêque Varlaam a refusé, invoquant des interdictions législatives.

L'église n'a pas survécu, mais ses photographies permettent de déterminer le style comme une direction officielle dans le « style russe ». Le temple était construit en briques rouges, enduit et blanchi, et avait une composition en trois parties. L'église à coupole unique était ornée de pilastres classiques et d'un entablement, tandis que le tambour du dôme et l'encadrement des ouvertures des fenêtres étaient réalisés sous forme d'arcs en forme de kil. Le clocher octogonal avait un étage de cloche. Il est possible que l'auteur du projet de l'église ait été l'architecte Gavriil Stepanovich Vershinin. En 1896, un vestibule et un clocher ont été ajoutés grâce aux fonds du marchand Grigori Vasilievich Shkroev, ce qui a permis d'accueillir 400 personnes.

Lors de la fête du temple, une procession était organisée dans le cimetière. Une chapelle-mémorial était associée à l'église. En 1914, sept femmes vivaient dans l'hospice du cimetière. Les recteurs de l'église étaient des prédicateurs omiens connus : dans les années 1900, le prêtre Vasily Plyaskin, dans les années 1910, le prêtre Mikhail Orlov.

Pendant la Première Guerre mondiale, les soldats et les réfugiés décédés étaient célébrés gratuitement. Près de l'église, des habitants célèbres d'Omsk ont été enterrés : le général-lieutenant V.S. Tsytovich, le prêtre et historien de l'Église A.I. Sulotsky, l'architecte I.G. Khvorinov, les marchands V.P. Kuznetsov, G.V. Shkroev, S.S. et F.S. Volkovi, S.N. Moskalyitin, O.V. et V.T. Razumovski, plus tard le docteur F.I. Bill, le scientifique P.L. Dravert, le professeur N.D. Liberov.

Depuis 1920, l'église est devenue paroissiale. La paroisse était l'une des plus grandes d'Omsk : en 1926, 89 personnes, en 1927, 312. En 1937 et 1938, il y avait 30 paroissiens, les prêtres Kiselev et Tatishchev officiaient, et A.M. Sukovatitsina était la présidente de la communauté. L'église a été fermée en février 1938 et a été transformée en entrepôt « Vodnik ».

Pendant la Grande Guerre patriotique, de nombreuses demandes des croyants pour rouvrir l'église de Tous les Saints à Omsk ont été rejetées, en se basant sur le fait qu'elle se trouvait à un kilomètre de l'église active, ce qui était faux, car l'église de la Croix était située de l'autre côté de l'Om, loin du cimetière cosaque.

Le sort de l'église de Tous les Saints préoccupait un employé, puis directeur du musée local A.F. Palashenko. En 1948, il a tenté d'ouvrir un musée de l'histoire d'Omsk dans le bâtiment de l'église. Dans une demande du 10 avril 1949, Andreï Fiodorovitch indiquait que le musée d'Omsk disposait d'une grande collection de plans, de dessins, de photographies et d'objets qui n'avaient pas d'endroit pour être exposés. Le conseil municipal a décidé de transférer l'église pour y établir un musée et a envoyé une demande au Conseil des ministres de l'URSS. Cependant, l'initiative n'a pas abouti. Le Conseil des affaires de l'Église orthodoxe russe auprès du Conseil des ministres de l'URSS a décidé le 9 mai 1949 : « Considérer inopportun l'utilisation de l'église du cimetière comme musée ». Les dernières années, l'église est restée vide et s'est progressivement détériorée.

Le 31 janvier 1966, une conférence constitutive de la section régionale de la Société panrusse de protection des monuments d'histoire et de culture a eu lieu, contribuant de manière significative à la sauvegarde des monuments locaux. Mais même à cette époque, il y a eu des pertes : en 1975, l'église de Tous les Saints au cimetière cosaque a été démolie. Sur le territoire du cimetière, des hôpitaux pour enfants et infectieux ont été construits.

À la fin de 2004, à l'initiative du gouverneur de la région d'Omsk L.K. Polezhaev, une nouvelle église en bois au nom de Tous les Saints a été érigée à cet endroit historique. L'archevêque d'Omsk et de Tarsk Feodosiy a consacré l'église et a célébré la première liturgie le 7 janvier 2005, le jour de la naissance du Christ.