L'église du saint prince bienheureux Michel de Tchernigov a été construite en 1913 grâce aux fonds collectés par des propriétaires de datchas aisés de Saint-Pétersbourg. Le projet de l'église, réalisé dans le style néo-russe, a été conçu par l'architecte de la cour, l'académicien V. Pokrovski, et a été approuvé par l'empereur Nicolas II.

Le 23 septembre 1913, une inspection de l'église-chapelle, construite sous la direction de l'architecte S. Kallistratov, a eu lieu, et le 6 octobre 1913, l'évêque de l'éparchie de Soukhoumi a célébré la Grande consécration de l'église.

Après la révolution de 1917, l'église a été fermée. Dans son bâtiment, un club a d'abord été installé, puis une sous-station électrique. Après la guerre, le bâtiment est resté vide et s'est progressivement détérioré.

En 1992, l'église de Michel de Tchernigov à Gelendjik a été inscrite sur la liste des églises orthodoxes pré-révolutionnaires conservées lors de l'inventaire des objets du patrimoine historique et culturel. En 1995, un terrain de 0,6 hectare avec le bâtiment de l'église à moitié détruit a été transféré au Monastère de Tchernigov de la Laure de la Sainte-Trinité de Sergueï.

Grâce aux efforts du supérieur du Monastère, l'archimandrite Théophylacte (Moïseïev), aujourd'hui évêque de Dmitrov, vicaire du Patriarche de Moscou et de toute la Russie, la restauration de l'église a commencé. Au cours des travaux de réparation, l'église a été revêtue de briques rouges, ce qui a modifié l'apparence initiale des façades et les proportions du clocher. Un narthex a également été ajouté à l'église. À l'intérieur, des travaux de finition ont été réalisés et un iconostase en fresque, amené de Moscou, a été installé. L'hiéromoine Varnafa (Kliouchine) a commencé à célébrer régulièrement des offices.

Le Monastère offre repos et réhabilitation dans un cadre familial pour les enfants orphelins sourds et muets et les personnes handicapées du foyer pour enfants de Sergueï.

En 2017, Olga Kovalik, avec la bénédiction du supérieur, a préparé un livre sur l'histoire de l'église. Le texte du livre peut être consulté via le lien.