Depuis les années 1990, les touristes russes ont commencé à affluer en Thaïlande. La ville de Pattaya, connue comme la station balnéaire la plus « russe » de Thaïlande, a rencontré un grand succès parmi les touristes de l'ex-URSS.

Depuis le milieu des années 2000, l'igoumène Oleg (Tcherépanine), représentant de l'Église orthodoxe russe en Thaïlande, a commencé à célébrer des offices à Pattaya pour de nombreux touristes russophones. En juillet 2008, il a été décidé d'organiser une paroisse orthodoxe à Pattaya au nom de tous les saints, ainsi que de l'inclure dans l'Église orthodoxe de Thaïlande sous la juridiction du Patriarcat de Moscou. En novembre 2009, une église a été construite dans la partie nord de Pattaya.

Avec le renforcement des positions de l'orthodoxie à Pattaya, il a été décidé de construire une autre église orthodoxe. En août 2011, l'Église orthodoxe en Thaïlande a reçu en don un terrain pour la construction d'une deuxième église dans le sud de la ville, dans le quartier de Jomtien. Il était prévu que ce soit une église basse dans le style russe traditionnel avec cinq dômes dorés. Au sous-sol du bâtiment, des logements pour le prêtre étaient prévus.

La construction de la deuxième église orthodoxe à Pattaya devait également changer l'image de la station balnéaire, qui devait être transformée en centre de tourisme familial et écologique au cours des 10 prochaines années.

Le 6 janvier 2014, l'église a ouvert ses portes pour la première fois aux fidèles. Depuis mars 2014, un cinéma orthodoxe a commencé à fonctionner à l'église de la Protection.

Le 12 décembre 2017, l'évêque d'Zvenigorod, Antoine (Sevriouk), avec l'archimandrite Oleg (Tcherépanine) et le prêtre Ioann Moroz, a consacré une croix en marbre érigée près de l'église en l'honneur du 15e anniversaire de la présence de l'Église orthodoxe russe en Thaïlande.