L'église de l'Épiphanie, également connue sous le nom de Kukshinskaya, a été construite au début du XVIIIe siècle, et les dernières modifications de son architecture ont eu lieu en 1875. Le bâtiment principal est un carré avec des demi-dômes, surmonté d'un octogone. En 1875, une salle à manger a été ajoutée avec des chapelles dédiées à Kuksha de Pechersk et aux saints Pierre et Onuphre, ainsi qu'un clocher de style classique.

La première mention de l'église se trouve dans le Livre des Actes de 1625-1626, rédigé par le scribe Vassili Vassilievitch Tchernyshev et le clerc Osip Bogdanov. Il y est fait mention de deux églises en bois qui se trouvaient à cet endroit : l'Épiphanie et celle de la Sainte Parascève. Les deux églises étaient situées sur le territoire de la ville de Mtsensk, dans la ville tressée, et les portes à proximité étaient appelées les portes de l'Épiphanie. L'une des églises était froide et spacieuse, tandis que l'autre était chaude, c'est-à-dire chauffée en hiver. Des cours pour le clergé et plusieurs cours de paysans se trouvaient à proximité des églises. La consécration de l'une des églises au nom de la Sainte Parascève indique la présence d'un marché urbain, ce qui n'est pas surprenant, car de la porte de l'Épiphanie partait la route vers Orel. Plus tard, dans les documents de la seconde moitié du XVIIe siècle, seule l'église en bois de l'Épiphanie est mentionnée.

Au XVIIIe siècle, l'église en bois a été remplacée par une église en briques, construite par le marchand Borovitine et le fonctionnaire Anofri Khodanov. En 1915, A.I. Firsov a décrit l'église comme étant située à la périphérie de la ville, sur une colline surélevée par rapport à la voie ferrée, sur un ancien cimetière. L'église en pierre, dédiée à l'Épiphanie, était la plus ancienne de la ville. Elle est restée longtemps sans paroisse et a progressivement décliné, son clocher s'inclinant et menaçant de s'effondrer. En 1875, une fraternité au nom du saint martyr Kuksha a été fondée auprès de l'église, qui a restauré l'ancienne église et ajouté un nouveau clocher et une salle à manger avec des chapelles. L'église était petite et sombre, et sa relique était une parcelle des reliques de saint Kuksha. Dans la partie droite de l'iconostase se trouvait un cercueil en bois de cyprès avec une icône du saint martyr, où il est représenté en pleine tenue. Les reliques du saint martyr reposent dans les grottes Antoniev de la laure de Kiev-Pechersk, et une partie d'entre elles a été solennellement amenée dans la ville le 26 août 1895.

L'église de l'Épiphanie a été fermée dans les années 30 du XXe siècle. Elle a beaucoup souffert pendant la Grande Guerre patriotique, et peu après sa fin, les ruines de l'église ont été démolies.