L'École Spirituelle de Volsk, fondée en 1847, n'a pas eu de propre église pendant plus de cinquante ans. En 1903, grâce aux efforts des évêques Jean Kratir et Saint Germogène Dolganov, un nouveau bâtiment de l'école a été construit.

Le 5 octobre 1903, Son Éminence Germogène, avec les participants du congrès des délégués du district de Volsk du Conseil des Écoles de l'Éparchie de Saratov, a consacré dans l'école une église domestique en l'honneur des Trois Saints Pères : Basile le Grand, Grégoire le Théologien et Jean Chrysostome. Un don important pour l'embellissement de cette église a été fait par le doyen de la Cathédrale, le prêtre Matthieu Vassiliev. Le premier prêtre de l'église des Trois Saints fut le prêtre Pavel Polikarpovitch Orlov.

En 1907, en raison des troubles révolutionnaires, les classes 1 et 2 de la Séminaire Spirituelle de Saratov ont été transférées à l'École Spirituelle de Volsk, où pouvaient entrer les diplômés de la classe 4 de l'École Spirituelle. À cette époque, le surveillant de l'école était l'hiéromoine Boris Sokolov, qui est devenu recteur de la Séminaire Spirituelle de Saratov en 1914. Le dernier surveillant de l'école, l'archimandrite Gabriel Abalymov, a dignement soutenu son nouveau statut.