L'église au nom de la Trinité Vivifiante a été construite en 1598 à l'initiative de Boris Godounov, qui venait de devenir tsar de Moscou, dans le village de Khoroshevo, sa propriété. Le palais voisin a été démoli par la suite, et l'église de Khoroshevo est restée la seule partie de l'ensemble palatial de Godounov. Le nom « Khoroshevo » est associé à la beauté de ces lieux. Pendant le Temps des Troubles, lorsque le camp de False Dmitry II était à Tushino, ses partisans appelaient l'ancienne propriété de Godounov « monastère Nékhoroshevo ».

L'église a été construite sur le modèle de la Petite cathédrale du monastère de Don, érigée cinq ans plus tôt : presque de forme cubique, avec une seule coupole et une rangée de kokoshniks. Il existe une version selon laquelle les deux temples ont été construits par l'architecte Fiodor Koni, qui a également créé le mur de la ville blanche à Moscou et le Kremlin de Smolensk. Cependant, il y a des différences : dans la cathédrale de Don, les chapelles ont été ajoutées plus tard, tandis qu'à Khoroshevo, elles ont été construites immédiatement, ce qui est lié au statut particulier de l'église. Une chapelle a été consacrée en l'honneur de Boris et Gleb, l'autre, au nom de Théodore Stratilate, les patrons de Boris Godounov et de son fils Fiodor.

Une attention particulière est attirée par la rangée de kokoshniks qui couronne l'église. Auparavant, dans leurs demi-cercles se trouvaient des plats ronds émaillés de la ville turque de Nice, mais maintenant leurs restes sont conservés dans un musée, et seules des empreintes restent sur la façade.

Au fil du temps, l'apparence du temple a changé. D'abord, les fenêtres étroites ont été élargies, puis au milieu du XVIIe siècle, une galerie couverte est apparue autour du carré sur des arcades. En 1745, une nouvelle cloche à trois niveaux a été construite au-dessus de l'entrée ouest pour remplacer l'ancienne. En 1845, une partie de la galerie a été remplacée, et la salle à manger existante a été construite. Différentes parties de l'église des XVIe et XIXe siècles ont été réunies. Les intérieurs ont également changé : le premier iconostase n'a pas survécu, les murs et les voûtes ont été repeints, la sculpture sur les portails a été taillée, les chapelles ont été élargies, et leurs murs ouest ont été démolis. Cependant, la base de l'ancienne église est restée presque inchangée.

À l'été 1939, les services religieux ont cessé, et le bâtiment a été utilisé pour une consultation pédiatrique et un club de kolkhoze. En 1963-64, l'architecte B.L. Altshuller a mené une étude détaillée et une restauration du temple, précisant sa datation et ses caractéristiques architecturales. Après cela, le bâtiment a abrité un atelier d'imprimerie offset, puis un salon « Pierres colorées ». En 1989, le premier service religieux a eu lieu dans le temple, marquant le début du transfert progressif du bâtiment à la communauté orthodoxe.