L'église est située à l'emplacement de l'ancien monastère masculin de la Trinité, qui était connu depuis 1626. Le temple principal du monastère était dédié à la Sainte Trinité et avait une chapelle en l'honneur du saint Alexandre de Svir. Dans le peuple, il était appelé "Trinité Noire" pour le distinguer de l'église paroissiale voisine, appelée "Trinité Blanche".

Après le décret de Catherine la Grande sur la création des États monastiques, le monastère a été fermé et ses temples sont devenus des paroisses. À ce moment-là, le temple de la Trinité était très délabré, et il était presque impossible d'y célébrer. Le prêtre Panteleimon Ivanov, avec les paroissiens, a demandé aux autorités ecclésiastiques la permission de construire une nouvelle église en pierre. L'autorisation a été obtenue le 28 mars 1766. La construction du nouveau temple a duré environ 15 ans, et le principal autel a été consacré en 1777. En 1833, le temple a été renommé en église Saint-Esprit pour le distinguer de l'église voisine de la Trinité, "Trinité Blanche". La paroisse a toujours été pauvre et a même été rattachée plusieurs fois à d'autres. La rue principale Golodaevka, aujourd'hui Proletarskaya, explique la raison de cela.

Après la révolution, le 8 mai 1929, l'église a été l'une des premières dans la ville à être fermée et transférée à l'imprimerie du Promkombinat. Le clocher a été partiellement détruit, le dôme a été démoli, et le bâtiment lui-même a été modifié par des annexes. En 1995, l'imprimerie a été transférée dans un nouveau bâtiment, et l'église a été remise à la communauté des croyants "Cyprès". Le temple défiguré avait besoin d'une rénovation complète. Le premier service a eu lieu le 17 décembre 1995, lors de la fête de la grande martyre Barbara. Le recteur du temple, un jeune prêtre, diplômé du séminaire spirituel de Moscou, Sergueï Julien, a dû déployer beaucoup d'efforts pour restaurer la beauté de la Maison de Dieu.

Malgré les conditions difficiles pour la célébration des offices, l'église du Saint-Esprit est devenue l'une des préférées de la ville. Une école du dimanche pour les enfants a été ouverte au sein de la communauté des croyants, et des cours de catéchisme ont été organisés.