Le 2 septembre 1917, l'église de Nicolas a été consacrée à Kounour. Elle a été construite à l'emplacement de l'église en pierre de Jean-Baptiste, qui avait servi de cimetière jusqu'en 1834. La construction de la nouvelle église a commencé après la mort du marchand de première guilde et conseiller d'État Alexeï Semyonovitch Goubkine.

A.S. Goubkine, citoyen d'honneur de Kounour, est décédé à Moscou, et selon son testament, son corps a été transféré à Kounour pour être enterré dans l'ancien cimetière de Jean-Baptiste. Son petit-fils, Alexandre Grigorievitch Kouznetsov, vivant à l'étranger, a décidé, sur les conseils du prêtre local Mikhaïl Ivanovitch Kholmogorov, de construire une nouvelle église à l'emplacement de la sépulture de son grand-père. Le projet a été confié à l'architecte permien A.B. Tourtchevitch.

En 1894, la Douma de Kounour a attribué un terrain pour créer un parc près de la future église. Le 27 avril de la même année, le démantèlement de l'ancienne église a commencé, et le 22 mai, la nouvelle a été posée. Le comité de construction était dirigé par M.I. Kholmogorov, sous la direction duquel les travaux principaux ont été achevés, et l'église a été ornée de coupoles dorées. Les intérieurs et les iconostases ont été commandés au professeur de l'Académie des beaux-arts de Saint-Pétersbourg Nikolaï Nikolaïevitch Kharlamov, qui a utilisé dans ses esquisses des fleurs des environs de Kounour.

Les chapelles latérales de la nouvelle église de Jean-Baptiste ont été consacrées les 9 et 16 novembre 1903, tandis que le temple principal a été consacré le 20 août 1917. Jusqu'en 1910, des calorifères ont été installés dans l'église.

Le temple comprenait une chapelle en l'honneur de la Mère de Dieu "Source de Vie" et du martyr Christophe, construite en 1886.

L'église de Nicolas a été fermée le 9 janvier 1931 et a longtemps été utilisée comme local de production. En 1990, le bâtiment a été restitué aux croyants, et la restauration a commencé. Le 12 mai 1996, le patriarche de Moscou et de toute la Russie Alexis II a visité l'église, et à l'automne 1997, la restauration du clocher a été achevée.

L'église a une composition traditionnelle avec un clocher, une salle à manger avec une chapelle et un bâtiment principal à cinq dômes avec une abside. Le carré avec une abside à deux niveaux se distingue par sa monumentalité. Les façades sont ornées de décorations en briques et en pierre locale, tandis que le silhouette de l'église est animée par les verticales du clocher à trois niveaux, le sommet en forme de tente et les dômes des chapelles.