L'église de Jean Baptiste est mentionnée pour la première fois dans des documents du début du XVIIIe siècle et est située derrière les portes de Tver de la ville blanche, dans le quartier de Bronnikov. Cette église paroissiale est connue depuis le XVe siècle et était le centre d'un faubourg où vivaient des artisans fabriquant des armes. En 1570, des maîtres étrangers en fabrication de sabres y furent déplacés sur ordre d'Ivan le Terrible.

Le temple en bois existait depuis 1605, et en 1615, le tsar Michel Fiodorovitch lui offrit une icône de Jean Baptiste. L'église en pierre, remplaçant le bâtiment en bois, fut construite en 1665, bien que les travaux aient pu commencer en 1652.

Au milieu du XVIIe siècle, le territoire de l'église mesurait 25 sur 25 sajenes et incluait les cours des clercs. À l'est, la cour de Pierre Bedrine, représentée sur le plan de Moscou de 1768, y était adjacente. À la fin des années 1670, un nouveau cimetière et un hospice pour 100 pauvres y furent établis.

L'église se composait d'un quatuor à deux lumières avec cinq coupoles et d'un autel à trois parties. En 1694, une chapelle dédiée à Nicolas fut construite. Au XVIIIe siècle, le territoire de l'église resta inchangé, et dans les années 1740, un nouveau clocher fut construit. Après la peste de 1771, le cimetière fut supprimé et son territoire passa au prince I. A. Viazemski.

En 1812, l'église fut endommagée par un incendie, mais elle fut restaurée en 1814. En 1836, une chapelle au nom de Mitrophane de Voronej fut aménagée. En 1842, l'église fut rénovée par le métropolite Philaret. L'architecture de l'église resta inchangée, à l'exception des annexes au clocher.

Au début du XXe siècle, les biens de l'église généraient des revenus, une partie des bâtiments étant louée. En 1933, le temple fut fermé, le bâtiment fut transféré à un théâtre, et son architecture fut partiellement détruite. L'icône de Jean Baptiste se trouve maintenant dans l'église de la Résurrection, tandis que l'emplacement de l'icône de la Mère de Dieu « Compassion » est inconnu.

Jusqu'en 1960, le temple abritait un dortoir, puis des ateliers de théâtre. De grandes ouvertures furent faites dans le bâtiment pour les décors, et un garage fut aménagé. La restauration commença en 1956, mais les travaux actifs sur le clocher débutèrent en 1973. En 1993, le bâtiment fut restitué à l'Église orthodoxe russe. La restauration se poursuit, avec des projets de rétablissement de la clôture et de libération du territoire. Le temple se trouve sur le site d'un monument archéologique du faubourg de Bronna.