Au cimetière orthodoxe, en plus de l'église de la Pentecôte, se trouvaient trois autres églises annexes. L'une d'elles, dédiée à Saint Athanase d'Athos, était située dans la partie ouest du cimetière. À l'origine, elle était monastique et a longtemps été liée au monastère de la Transfiguration. En 1653, le tsar Alexis Mikhaïlovitch a cédé au monastère un terrain où les moines ont construit une église en bois en l'honneur de Saint Nicolas, qui servait de soutien spirituel aux moines et aux travailleurs. En 1744, l'archimandrite Méthode a remplacé l'église en bois par une église en pierre, consacrée au même nom. L'ancienne église a été déplacée dans le jardin du monastère et consacrée en l'honneur de Saint Athanase d'Athos, qui était considéré depuis longtemps comme le patron du monachisme.

À l'intérieur de l'église se trouvait un iconostase à quatre niveaux, créé en 1892 grâce aux fonds du marchand D.I. Artemiev. Les autels latéraux étaient ornés d'iconostases sculptés à un niveau, dont l'un a été aménagé grâce aux fonds du marchand V.I. Smirnov en 1882. La fresque de l'église a été réalisée en 1847 sous l'archimandrite Vassian et mise à jour en 1892. Autour de l'église se trouvaient des sépultures de moines et d'habitants d'Astrakhan. Parmi eux se trouvait le bienheureux Pierre Andreïevitch Sazonov, enterré près du chœur gauche.

En 1923, l'église de la Pentecôte a été saisie par les rénovateurs, tandis que les deux autres églises du cimetière sont restées scellées. L'église d'Athanase d'Athos est devenue la seule église orthodoxe en activité au cimetière. Après la saisie par les rénovateurs des églises de l'archange Michel et de l'Entrée de la Vierge, les paroissiens ont rejoint l'église d'Athos, qui a commencé à remplir des fonctions paroissiales.

En 1932, l'église d'Athanase d'Athos a été fermée et bientôt démolie. Pendant longtemps, elle a été rappelée par un bâtiment en pierre de trois étages, servant de logement pour les prêtres. Dans les années 70, la partie ouest du cimetière, où se tenait l'église, a été démolie avec le bâtiment de l'église. Les restes de certains prêtres ont été transférés dans la partie conservée du cimetière, les autres sépultures ont été détruites. À la place du cimetière, des garages ont été construits pour les travailleurs du comité régional du parti, qui subsistent jusqu'à nos jours.