La tour a été construite par l'architecte italien Pietro Antonio Solari en 1490 et servait d'entrée à la partie utilitaire de la cour du tsar, séparée de la zone de parade par un mur en pierre, érigé en 1499.

Il est intéressant de noter qu'à la demande du tsar Alexeï Mikhaïlovitch, la tour Borovitskaya a été renommée en 1658 en l'honneur de l'église de la Nativité de Jean-Baptiste située à proximité. Cependant, l'ancien nom de la tour a été conservé et a survécu jusqu'à nos jours.

À l'origine, la tour était un puissant carré avec un toit en bois. Dans les années 1680, trois carrés décroissants ont été construits au-dessus, un octogone ouvert et un toit en pierre, donnant à la tour une forme pyramidale à étages. À cette époque, une meurtrière a été ajoutée sur le côté de la tour, où des portes de passage avec une grille en fer et un pont-levis sur la rivière Neglinnaya ont été aménagées. Au XVIIIe siècle, lors de la restauration de la tour, des éléments néogothiques ont été ajoutés à sa décoration. En 1812, lors de l'explosion de la tour voisine de Vodovzvodnaya, le sommet du toit de la tour Borovitskaya s'est effondré. Entre 1816 et 1819, la tour a été restaurée sous la direction d'O.I. Bove.

En 1848, le trône de l'église de la Nativité de Jean-Baptiste a été transféré à la tour Borovitskaya et la décoration néogothique a été retirée.

Le carré principal de la tour à l'intérieur est divisé en deux étages avec des voûtes cylindriques. L'octogone est ouvert dans la cavité du toit avec des lucarnes, tous les étages sont reliés par un système d'escaliers dans l'épaisseur des murs. Dans le passage des portes de la meurtrière, des rainures verticales pour les herses ont été conservées.

La hauteur de la tour jusqu'à l'étoile est de 50,7 m, et avec l'étoile, de 54,05 m.