Le musée a été fondé à l'automne 1904 comme une institution pour la démonstration de supports visuels sous l'égide de la "Société de protection des enfants", dirigée par V.I. Lounine, un homme politique et public connu du Kouban. À l'origine, le musée comptait environ une centaine d'expositions et était situé dans une des salles du lycée féminin d'Armavir. Au fil du temps, le musée s'est agrandi, a changé plusieurs fois de lieu et s'est finalement installé à l'école Pouchkine, actuellement rue R. Luxembourg.

En 1911, le musée a changé de nom pour devenir "Musée d'Armavir des sciences et des connaissances appliquées en mémoire du 19 février 1861". En 1920, il est passé sous la tutelle de l'État, et en 1928, il a obtenu un nouveau bâtiment au coin des rues Lénine et K. Marx. Le musée comptait trois départements : la géographie, le travail et l'éducation sanitaire.

En août 1942, le bâtiment du musée a été détruit lors d'un raid de l'aviation fasciste, et tous les fonds ont été perdus. En 1948, le musée a temporairement reçu un manoir préservé au 114 rue Lénine, où il se trouve encore aujourd'hui. En novembre 1949, le musée a rouvert ses portes aux visiteurs, et toutes les expositions ont été rassemblées par l'équipe d'après-guerre.

La collection du musée comprend des découvertes paléontologiques, telles que des os de mastodonte, de rhinocéros, d'hypparion, de tigre à dents de sabre et de faune marine. Parmi elles se distingue un énorme crâne d'éléphant trogontherium, qui habitait le Kouban il y a 250 000 ans. Les collections archéologiques sont issues d'expéditions sur le territoire du Kouban central depuis 1967, y compris des bijoux en or des cultures de Maïkop et du Nord-Caucase, de la culture scythe, des Méotes et des Sarmates, ainsi que des Alains. Une collection unique de sculptures en pierre scythes et polovtses, principalement trouvées dans les environs du hameau de Gorkaya Balka, est également présentée au musée. La collection comprend un monument de la culture kimmérienne, la "pierre du cerf", ainsi que de la céramique en laque noire et rouge et des statuettes en terre cuite.

Une valeur particulière est accordée à la collection d'armes des XVIIIe et XXe siècles, comprenant des poignards, des sabres, des fusils et des pistolets de l'époque de la guerre du Caucase, ainsi que des armes des guerres civiles et de la Grande Guerre patriotique.

Les fonds du musée conservent également des collections de samovars, principalement de production toulousaine, de meubles des XIXe et début XXe siècles, de porcelaine "kouznetz" et une collection ethnographique reflétant la vie quotidienne de divers peuples vivant à Armavir.

La collection d'art visuel comprend trois études de M.V. Nesterov, réalisées à Armavir : "Paysage marin", "Vue sur un navire" et "Vue sur un manoir".

La collection d'icônes des XIXe et début XXe siècles est également intéressante. Depuis le début du troisième millénaire, une attention particulière est accordée à l'enrichissement de la collection d'icônes orthodoxes, qui se distinguent par leur couleur et leur style des icônes de la Russie centrale et de son Nord. Parmi elles, on trouve "La Trinité", "Le Seigneur Tout-Puissant", "La Protection" et d'autres.

Le musée conserve également une petite mais significative collection de livres anciens russes imprimés et manuscrits, ainsi que des éditions de magazines et de journaux d'avant la révolution, reflétant le développement de l'imprimerie.