La moderna campanario, construida en 1603 cerca del antiguo campanario sobre las celdas de los kelar, fue erigida con fondos de D.I. Godunov. Está diseñada a imagen del campanario de la catedral en Rostov Veliky, pero de menor tamaño, en forma de galería con tres arcos. Bajo los dos arcos inferiores se encuentran almacenes, y bajo el superior, en cuatro tramos abovedados, están las campanas. Sobre el tramo norte, que se asemeja a una torre cuadrada y se eleva sobre las demás partes del edificio, se ha instalado una alta cima de piedra en forma de tienda, que más tarde fue ampliada y cubierta con chapa metálica. En esta torre se conservan partes del mecanismo de antiguos relojes de campana, que probablemente pertenecen al tipo de relojes de la torre de Evfimiev en Novgorod. Según la inscripción en la campana de guerra, estos relojes fueron instalados en 1659 con fondos de D.I. Godunov. En el lado oeste, se ha añadido a la campanario una terraza de piedra con techo de hierro, a la que se accede por una escalera de piedra con barandillas de hierro.

En 1908, la campanario fue reparada, y en la torre de la cima se renovó la pintura exterior en tres lados. Sin embargo, debido al rápido deterioro de la pintura y la falta de correspondencia con el acabado de la catedral de la Trinidad, en 1912, durante la restauración del monasterio de Ipatiev, se decidió devolver a la campanario su apariencia original. Actualmente, en el campanario del monasterio hay 10 campanas. De las antiguas, se ha conservado la más grande, que pesa 600 puds, fundida el 20 de septiembre de 1648 por orden del zar Alexei Mikhailovich. Esta campana, probablemente, fue refundida de una campana anterior, que también pesaba 600 puds, donada al monasterio por la madre de Boris Godunov. La segunda campana más grande pesaba originalmente 172 puds y fue fundida durante el reinado de Boris Godunov. Después de una grieta, fue refundida en 1894 aumentando su peso a 208 puds y 2 libras. La tercera campana, que pesa 104 puds y 25 libras, fue refundida en 1812. La cuarta campana, que pesa 68 puds, fue donada por D.I. Godunov y refundida el 1 de agosto de 1659. La quinta y sexta campanas fueron refundidas durante el reinado de Alexei Mikhailovich. No hay fechas de origen para las demás campanas. En 1912, la cima de la campanario fue cubierta con tejas verdes, y también se abrieron algunas ventanas y arcos para restaurar la apariencia anterior de la campanario.

El conjunto histórico de campanas en el campanario del Monasterio de la Santa Trinidad no se ha conservado, ya que durante la época de Pedro la mayor parte fue refundida para la fabricación de cañones. Las campanas actuales pertenecen a diferentes períodos. La última campana, "Czar Mikhail", fue fundida en 2006 en honor al 400 aniversario de la ascensión al trono ruso del zar Mikhail Fyodorovich y fue donada por Michael, el Príncipe de Kent.