La iglesia Znamenskaya tiene su historia desde el templo de madera, construido en 1703 en honor a la icono de la Madre de Dios "Znameniye" (Abalakskaya) por el noble Iván Kachalov de Uglich.

Para finales del siglo XVIII, la iglesia se había deteriorado, y tras un incendio se tomó la decisión de construir un templo de piedra. Los fondos para la construcción fueron proporcionados por los descendientes de Kachalov. La colocación de la nueva edificación se llevó a cabo en 1789, y fue realizada en el estilo del barroco siberiano. En el templo había tres capillas.

Antes de la revolución de 1917, en la capilla del norte había dos grandes íconos en marcos de plata, pintados por encargo de una rica feligresa, cuyo nombre es desconocido. Aquí también se guardaba un relicario de plata con las reliquias de la santa gran mártir Bárbara. Una de las reliquias más sagradas era parte del árbol vivificante de la Cruz del Señor. En el templo había íconos con partículas de las reliquias del profeta Juan Bautista, el evangelista Marcos, el príncipe Dimitri, el apóstol Pablo y otros santos. También había un ícono de Cristo Salvador, tallado en piedra de aspid negro, shungita. Con la llegada del poder soviético, todas estas reliquias se perdieron.

En 1920, la iglesia fue nacionalizada, pero los servicios continuaron. Durante algún tiempo, la iglesia Znamenskaya colaboró con el nuevo poder. Sin embargo, el 26 de marzo de 1935, por decisión del Comité Ejecutivo de Siberia Occidental, la iglesia fue cerrada. Después de eso, el edificio se utilizó como base de la Flota de Madera, almacén de granos, y luego como local para la administración fluvial, herrería, calderería, garaje, sala de calderas y estación de barcos. También sirvió como vivienda.

En 1992, la comunidad de la iglesia de la Santísima Trinidad comenzó la restauración de la iglesia Znamenskaya. En 2004, se instalaron campanas en el campanario, y en 2005 se completó la restauración de la capilla central Znamenskaya.