En los últimos cincuenta años, el Museo de Bellas Artes de Yaroslavl se ha consolidado como un respetado centro de investigación científica. En su edificio principal se presentan las exposiciones principales dedicadas al arte ruso del siglo XVIII y principios del siglo XX, así como al arte del siglo XX. Al edificio se adhiere un parque con la exposición "Jardín del Gobernador. Escultura al aire libre". En las Cámaras Metropolitanas se ha inaugurado una exposición de arte antiguo ruso del siglo XIII al XIX. En 2014, se abrió el Museo de Arte Extranjero en la Plaza Soviética, donde se exhibe arte de Europa Occidental del siglo XVI a principios del siglo XX y arte de Oriente. En la aldea de Rybnitsy funciona una sucursal del museo, la Casa-Museo del escultor A.M. Opekushin con la exposición "Maestro de la escultura en relieve". En Tutayev se encuentra la sucursal "Casa en Novinskaya" con las exposiciones "Banco Provincial" y "Apartamento del gerente del banco". En 1986, el museo adquirió una colección de pintura, gráficos, medallas, monedas y vajilla, reunida por V.V. Ashik. La transferencia de la colección, que cuenta con 22 mil objetos, se llevó a cabo desde 1986 hasta 2000. Desde 1996, el museo organiza lecturas científicas sobre el estudio del arte antiguo ruso, dedicadas a la memoria de la investigadora de la iconografía de Yaroslavl, Irina Petrovna Bolotseva. El museo publica anualmente "Recopilación de lecturas científicas", así como catálogos de sus colecciones de iconografía y gráficos. Se está trabajando en un catálogo de pintura. El Museo de Bellas Artes de Yaroslavl se dedica activamente a la conservación de monumentos antiguos, creando copias para iglesias en funcionamiento. En 2010, con motivo del milenario de Yaroslavl, el museo preparó copias de íconos de la Catedral de la Asunción del siglo XVII. Las copias fueron realizadas en el marco del programa federal "Cultura de Rusia" y se instalaron en el iconostasio de la nueva Catedral de la Asunción. En 2013, el museo asignó 300 mil rublos para la creación de una copia de "Marco de la icono de la Madre de Dios de Kazán con 20 relieves", que fueron entregadas al Monasterio Femenino de Kazán. El Museo de Bellas Artes de Yaroslavl fue uno de los primeros en Rusia en comenzar a realizar salones musicales en sus exposiciones. El conjunto "Barroco" interpreta música desde el barroco hasta la vanguardia y participa en eventos del museo. El museo participa activamente en acciones internacionales, como "La Noche de los Museos" y el festival "Intermuseum". Sus empleados han recibido repetidamente premios y becas, incluidos del Presidente de Rusia y de fundaciones benéficas. En 1997, el museo ganó el concurso "Ventana a Rusia", organizado por el periódico "Cultura". En 2000 recibió una beca del Instituto "Sociedad Abierta" para crear exposiciones en la sucursal "Casa en Novinskaya". En 2003, en el festival "Intermuseum", el museo recibió como donación equipo para fondos abiertos de pintura. En 2007, el proyecto "Artistas rusos en China" fue galardonado en el festival "Intermuseum-2007". En 2010, el museo recibió una beca del Presidente de Rusia para crear la exposición "Arte del siglo XX". En 2013, el proyecto "Casa en sección" fue galardonado en el concurso de la Fundación Benéfica V. Potanin, y el proyecto "Seminaristas en el museo" ganó en el festival "Intermuseum-2013". En 2015, el museo fue el único nominante ruso en el concurso internacional "Museo Europeo del Año 2016".