La iglesia de la Transfiguración fue una de las más antiguas en Saratov. Su construcción comenzó a finales del siglo XVII tras el regreso de Saratov a la orilla derecha del Volga en 1674 y el traslado del monasterio de Cuatro Santos, que se había quemado, a la ciudad en 1693. El monasterio se ubicó al pie de la montaña Sokolovaya, y su templo principal fue la iglesia en honor a la Transfiguración del Señor. Era de piedra, con una capilla lateral dedicada a los santos moscovitas Pedro, Alexis, Jonás y Felipe. En 1764, el monasterio recibió el nombre de Spaso-Preebrajenskoye. Después del incendio del 21 de junio (3 de julio) de 1811, el monasterio fue trasladado fuera de la ciudad, y la iglesia fue restaurada como parroquial con fondos del comerciante Jrisanfa Obraztsov. En 1825, el archimandrita Arsenio consagró la capilla de los cuatro santos, y el 14 (26) de junio de 1829, el obispo Moisés consagró el altar principal de la Transfiguración del Señor.

En 1868, con fondos del anciano de la iglesia Shchegolkov, se comenzó a construir una nueva capilla en memoria de la salvación de Alejandro II tras el atentado en París el 25 de mayo (6 de junio) de 1867. La capilla en honor a Juan el Bautista fue consagrada el 29 de noviembre (11 de diciembre) de 1870 por el archipreste local Smirnovski. A finales de la década de 1870, la parroquia de la iglesia contaba con 324 casas y alrededor de 3285 feligreses.

La antigua iglesia se volvió pequeña y deteriorada, por lo que en 1886 el ingeniero arquitecto provincial Shuster desarrolló un proyecto de reparación y ampliación del edificio. El proyecto incluía la reconstrucción del campanario y dos anexos al templo principal y al altar, a los que se accedía a través de cuatro arcos. En el interior, el edificio fue pintado con pintura al óleo, y los altares fueron decorados con imágenes sagradas. La primera donación de seis mil rublos para la reconstrucción fue realizada por la familia Shchegolkov. Los trabajos comenzaron el 14 (26) de junio de 1886 y finalizaron el 16 (28) de noviembre de 1897 con la consagración de las capillas reconstruidas.

A principios del siglo XX, la parroquia contaba con alrededor de 600 casas y 2500 creyentes. El personal del clero incluía dos sacerdotes, un diácono y dos salmistas, para quienes se construyeron casas parroquiales. En la iglesia funcionaba una escuela parroquial.

Durante la época soviética, la iglesia de la Transfiguración fue cerrada y destruida. Actualmente, en su lugar se encuentra un instituto de perfeccionamiento docente.