Hasta la revolución, en Novorossiysk existía la catedral de San Nicolás, construida en 1846. Durante la guerra de Crimea y tras la abolición temporal de la ciudad, fue parcialmente destruida, pero luego fue restaurada y reconstruida tras el regreso de los rusos. En 1930, la catedral fue cerrada y convertida en un club de guarnición, y en 1931 fue demolida. Ahora en su lugar se encuentra el café "Teatralnoe" en el Parque de Cultura y Ocio Lenin.

En 1892, en Novorossiysk había dos iglesias: la de San Nicolás y la de la Dolorosa. La iglesia de San Nicolás, la más antigua de la ciudad, fue construida en 1846 y estaba situada en la primera parte de la ciudad en una plaza conocida como Plaza de la Iglesia (hoy Parque Lenin). Era de piedra y cubierta de hierro. La iglesia de la Dolorosa se encontraba en la segunda parte de la ciudad, en Zatsemeskaya, que hasta 1900 no formaba parte del límite urbano. Esta iglesia era de madera y estaba en mal estado. Junto a estas iglesias comenzaron a aparecer las primeras escuelas parroquiales para niños y niñas. La primera mención de tales escuelas se refiere a la catedral de San Nicolás. La organización de las escuelas parroquiales estaba a cargo del párroco, el padre Mijaíl Pavlov, quien solicitaba su apertura y la asignación de terrenos para la construcción junto al templo.