Bis zur Revolution gab es in Noworossijsk die Nikolaikirche, die 1846 erbaut wurde. Während des Krimkriegs und nach der vorübergehenden Aufhebung der Stadt wurde sie teilweise zerstört, aber nach der Rückkehr der Russen wiederhergestellt und rekonstruiert. 1930 wurde die Kirche geschlossen und in einen Garnisonsclub umgebaut, und 1931 wurde sie zerstört. An dieser Stelle befindet sich jetzt das Café "Theatralnoje" im Kultur- und Erholungspark namens Lenin.

1892 gab es in Noworossijsk zwei Kirchen: die Nikolaikirche und die Schmerzhaften Kirche. Die Nikolaikirche, die älteste der Stadt, wurde 1846 erbaut und befand sich im ersten Teil der Stadt auf dem Platz, der als Kirchplatz bekannt ist (heute Lenin-Park). Sie war aus Stein und mit Eisen bedeckt. Die Schmerzhaften Kirche befand sich im zweiten Teil der Stadt, in Zazemesskaja, die bis 1900 nicht zur Stadtgrenze gehörte. Diese Kirche war aus Holz und baufällig. An diesen Kirchen begannen die ersten kirchlichen Schulen für Jungen und Mädchen zu entstehen. Die erste Erwähnung solcher Schulen bezieht sich auf die Nikolaikirche. Die Organisation der Kirchenschulen wurde von dem Pfarrer, Vater Michail Pawlow, geleitet, der Anträge auf deren Eröffnung und die Bereitstellung von Grundstücken für den Bau in der Nähe der Kirche stellte.