La inauguración solemne del Museo Local de Nerejta tuvo lugar el 14 de mayo de 1975. El museo se ubica en el edificio de una antigua "farmacia privada", construida a principios del siglo XX en estilo modernista. Inicialmente, el museo fue dirigido por Iván Fiódorovich Revín y Elizaveta Vasílievna Erofeeva. La base de las colecciones se compuso de objetos recolectados por el círculo de estudios locales en la Casa de los Pioneros bajo la dirección de Igor Georgievich Bolshakov.

En la década de 1980, comenzó la restauración de iglesias en Nerejta, iniciativa de N.P. Rodionova, quien encabezó la filial de Nerejta en 1983. Gracias a la restauración, el museo unió a todos los que buscaban la revitalización de la ciudad. En ese momento, el museo se convirtió en un centro cultural y espiritual de Nerejta. Tras la finalización de la restauración, se ubicó en dos iglesias, la de la Epifanía y la de la Resurrección, el campanario de Kazán y el edificio de la antigua "farmacia privada". En 1997, por decisión del gobernador de la región de Kostroma, V.A. Shershunov, se creó en el museo el centro espiritual y cultural "Camino hacia el templo".

En 2004, se inauguró en el museo la exposición "Nerejta. Una de muchas". En 2005, el museo recibió un Diploma y un premio especial del jurado en el festival "Intermuseum-2005" en Moscú por la mejor presentación del proyecto "Nerejta. Una de muchas". En 2004, el gobernador V.A. Shershunov decidió transferir el edificio del "Conjunto del Hospital Bryukhanov" al museo. Diez años después, el 2 de agosto de 2014, se llevó a cabo la inauguración solemne de un nuevo objeto museístico, coincidiendo con el 800 aniversario de Nerejta. La restauración se realizó bajo el patrocinio del gobernador Sergey Konstantinovich Sitnikov.

En 2009, Olga Mikhailovna Mayorova se convirtió en la directora del museo. En 2017, se inauguró en el patio de Varvarino del museo el Museo del Sueño en honor al primer vuelo en globo en 1731 por el habitante de Nerejta, Efim Kriakutny. Ese mismo año, al Museo Local de Nerejta, filial de OGBUK "Museo-Reserva Estatal Histórico-Arquitectónico y Artístico de Kostroma", se le otorgó el nombre de la trabajadora cultural merecedora Nina Petrovna Rodionova.

Durante más de 40 años, el museo se ha dedicado a la recopilación de archivos sobre la historia de la región, las familias mercantes, empresarios, benefactores, habitantes de Nerejta, pioneros y personas que hacen historia. En los fondos del museo se conservan colecciones únicas que incluyen cerámica, chalecos y pañuelos de Nerejta, libros antiguos, vestiduras eclesiásticas, samovares, planchas, cofres y mucho más, en total más de 12,000 unidades de almacenamiento.