La comunidad de Shamordino fue fundada en 1884 por el venerable Ambrosio de Optina, según el testamento de su hija espiritual, la monja Ambrosia (Klyuchareva, 1818-1881), y con sus fondos. Durante su vida, ella se preocupó por las viudas ancianas y los huérfanos que deseaban dedicarse al servicio de Dios, y legó la creación de una comunidad femenina en su propiedad de Shamordino.

Una invaluable ayudante del venerable Ambrosio en la creación del desierto fue su hija espiritual, la esquimona Sofía (Bolotova, 1845-1888). En el día de la apertura de la comunidad, el 1 de octubre de 1884, la madre Sofía fue nombrada su primera abadesa, y la comunidad recibió el nombre de Kazan en honor a la venerada icono de la Madre de Dios de Kazan. En 1987, fue glorificada en el Concilio de los Santos de Tula.

Toda la vida del desierto de Shamordino transcurrió bajo la dirección del anciano: el orden de los servicios, las normas monásticas y los asuntos de construcción se organizaban con la bendición del venerable Ambrosio.

Después de la madre Sofía, las abadesas fueron las esquigumenias Eufrosinia (Rozova, 1830-1904), Ekaterina (Sambikina, 1842-1911) y Valentina (Rozantseva, 1864-1919), también hijas espirituales del anciano Ambrosio y sus discípulos. A principios del siglo XX, la comunidad se convirtió en un importante centro espiritual, donde alrededor de 800 hermanas se dedicaban a la vida monástica. Gracias al apoyo del comerciante moscovita Sergey Vasilievich Perlov, se construyeron todos los edificios que han llegado hasta nuestros días: la catedral de Kazan, el asilo con la iglesia en honor a la icono de la Madre de Dios "Alivia mi tristeza", y un pozo. También se crearon varios talleres.

Durante los años de persecución al Ortodoxia, el desierto de Shamordino sufrió el mismo destino que muchos monasterios rusos. En 1923, la comunidad fue cerrada, y las hermanas se vieron obligadas a trasladarse a Kozelsk y a las aldeas cercanas, muchas de ellas murieron en prisiones y exilios.

Más tarde, las tierras de la comunidad pasaron a ser propiedad de un koljós, y en los antiguos edificios del monasterio se establecieron un hogar para inválidos, un internado y una escuela. Sin embargo, sin la bendición de Dios, la economía cayó en decadencia, y todo lo que había sido creado con el trabajo de las hermanas fue destruido.

Desde marzo de 1990, la vida monástica se reanudó en el desierto de Shamordino. La abadesa fue la igumenia Nikona (Peretyagina, 1941-2012) del monasterio de Riga. Se reanudaron los servicios, y la vida monástica comenzó a restaurarse. En el mismo año, el 27 de mayo, se consagró la iglesia del asilo en honor a la icono de la Madre de Dios "Alivia mi tristeza", lo que se convirtió en el día de renacimiento de la comunidad.

En 1996, en el lugar de la celda donde partió al Señor el venerable Ambrosio, se construyó la primera iglesia en Rusia en honor al gran anciano, consagrada el 28 de julio por el Santo Patriarca Alexis II. Esta iglesia se convirtió en una de las principales de la comunidad, donde se celebran servicios diariamente.

La celda del padre Ambrosio que se ha conservado ahora se encuentra junto a la iglesia, cerca de su lugar histórico.

El 13 de agosto de 2005, después de finalizar los trabajos de restauración, se consagró la catedral de Kazan, la iglesia principal del monasterio. El Santo Patriarca Alexis II y los arzobispos consagraron el altar central y dos laterales.

Hoy en la comunidad se celebra el ciclo completo de servicios, se lee el Salterio Nocturno, se realizan akathistos ante las veneradas iconos de la Madre de Dios y del venerable Ambrosio de Optina. Se han reabierto el asilo monástico y el hospital, y se ha organizado una escuela dominical para los niños de las aldeas cercanas. La comunidad tiene su propia economía: una granja lechera, huertos, campos, una colmena y se autoabastece completamente de productos. En Shamordino, más de ciento treinta hermanas se dedican a la vida monástica, que están completamente sostenidas por la comunidad.