La Iglesia de la Ascensión del Señor está situada en una pequeña colina a la orilla del río Mtsna, frente a la Montaña Catedral. En el siglo XVI, aquí se fundó el monasterio femenino de Arcángel, que dejó de existir durante el Tiempo de Troubles.

Según el libro de registros de Mtsensk de 1625, elaborado por Vasili Vasilyevich Chernyshov y el escribano Osip Bogdanov, en este lugar había dos iglesias de madera: la de la Anunciación de la Madre de Dios y la del Santo Arcángel Miguel. La iglesia de la Anunciación estaba en estado ruinoso. Junto a las iglesias había tres patios para los clérigos y el sacristán.

A mediados del siglo XVII, en Mtsensk se formó una comunidad femenina de unas veinte ancianas, que solicitaron la reactivación del monasterio. En 1659, el metropolitano de Saransk y Polonsk, Pitirim, emitió un decreto para la construcción del monasterio de las iglesias del Arcángel Miguel y de la Anunciación de Cristo. En 1662, por su orden, la anciana Eufrosinia Ivanovskaya fue nombrada constructora del monasterio de doncellas, y pronto comenzaron las obras de construcción del monasterio. Sin embargo, el monasterio estaba en medio del asentamiento y rodeado de patios, lo que provocaba frecuentes conflictos con los habitantes locales. En 1675, Andrei Yakovlevich Pyatovo, y luego Vasili Chertov y otros sirvientes de Mtsensk, donaron sus terrenos al monasterio, lo que permitió ampliar su territorio.

Según el libro de estimaciones de Mtsensk de 1691, en el monasterio había una iglesia de madera del Santo Arcángel Miguel. El 6 de mayo de 1695, durante un incendio en la ciudad, el monasterio de la Ascensión se quemó por completo.

Esta desgracia probablemente impulsó a la abadesa Fevroniya a comenzar la construcción, a finales del siglo XVII, de la iglesia catedral de piedra de la Ascensión, con tres altares: de la Ascensión del Señor, del Santo Arcángel Miguel y de San Juan Bautista, que continuó a principios del siglo XVIII. En el monasterio también había una iglesia de madera del Arcángel Miguel, que fue desmantelada tras la finalización de la construcción, y 27 celdas. En 1702, en el monasterio, además de la abadesa, había 56 monjas. En septiembre de 1744, regresando de Kiev, la emperatriz Elizabeth Petrovna visitó Mtsensk con el heredero Peter Fyodorovich, donando fondos para la construcción del campanario. En memoria de esta visita, la cruz de la iglesia fue coronada con una corona imperial.

El 23 de abril de 1757, el monasterio volvió a arder y fue restaurado bajo la dirección del capitán Rodion Yazikov por los contratistas comerciantes P. M. Moskvitinov y F. P. Inozemtsev. En ese momento, lo rodearon con un muro de piedra de más de 380 metros de longitud, con puertas y tres torres, que fueron desmanteladas en el siglo XIX. En 1764, el monasterio fue cerrado y transformado en iglesia parroquial. A mediados del siglo XIX, se añadió un pórtico de piedra a la iglesia, diseñado por el comerciante de Mtsensk Alexander Yakhontov.

En 1938, la iglesia fue cerrada y utilizada como club. En ese momento, perdió el tambor de luz y la parte superior del campanario. Durante la Gran Guerra Patria, los fascistas convirtieron la iglesia medio destruida en un punto de fuego, y sufrió graves daños en los combates.

Después de la guerra, la iglesia estuvo amenazada de destrucción total debido a la construcción de la carretera de Moscú a Simferopol a través de Mtsensk. Su salvación fue posible gracias a Mikhail Vasilyevich Kaplinsky, quien, entendiendo la futilidad de intentar proteger el edificio religioso, lo presentó como una construcción secular del siglo XVII. Esto fue posible debido a la pérdida de las características externas del edificio religioso. El encuentro de Kaplinsky con Grigory Grigoryevich Pushkin, descendiente de A. S. Pushkin, ayudó a convencer a los militares de la importancia del edificio. G. G. Pushkin confirmó las palabras de Kaplinsky con su autoridad, lo que finalmente salvó el monumento. Kaplinsky logró obtener fondos y materiales para la restauración del edificio, y en 1949, bajo su dirección, se realizaron reparaciones. El edificio fue cubierto con un techo de forma compleja, y comenzó a parecerse a una construcción residencial del siglo XVII, entrando en la literatura local como "la casa del boyardo".

En 1992, la iglesia de la Ascensión fue entregada a la comunidad de creyentes, y en 1995, la iglesia volvió a abrir sus puertas.