La construcción de la iglesia-capilla en honor a San Juan Bautista comenzó en 2001 bajo la dirección del futuro rector, el sacerdote Vladimir Voloshanov.

La edificación de la iglesia se llevó a cabo gracias al benefactor Ivan Ivanovich Evseev, quien la dedicó a la memoria de la iglesia del Bautista del Señor, destruida en los años soviéticos en su pueblo natal. También construyó un edificio auxiliar, donde se ubicaron la tienda de la iglesia y las oficinas.

El 7 de julio de 2004, en el día de la celebración del nacimiento de San Juan Bautista, el metropolitano Juvenal (Tarasov) realizó la solemne consagración de la iglesia.

Con la bendición del arzobispo de Kursk y Rylsk, Germán, el 1 de octubre de 2008, fue nombrado rector de la iglesia el protoiereo Anatoly Zayshly.