La iglesia de San Nicolás se encuentra en una terraza elevada sobre el valle del río Nepolod, donde desembocaba el seco arroyo Merin. La primera mención del pueblo de Bokanova aparece en el libro de tierras del distrito de Orlovsk en 1678, elaborado por Efim Markovich Norov y el escribano Savin Repyev.

En ese momento, el pueblo pertenecía al príncipe Iván Stepanovich Khotetovsky, quien tenía allí su corte señorial. Iván Stepanovich fue favorito de la zarina Sofía Alekseyevna y logró mantener su posición durante el reinado de Pedro I. Su hijo sirvió como estolnik bajo Pedro I y se compró su servicio en la flota mediante contribuciones monetarias.

La primera mención de la iglesia de madera de San Nicolás data de 1734, y también se menciona en documentos de 1755 y 1793. En 1802, 1807, 1854, 1872, 1885 y 1897, la iglesia fue reparada. En 1861, cuando Baklanovo se convirtió en el centro del volost y uno de los pueblos más poblados del distrito de Orlovsk, los feligreses decidieron construir una iglesia de piedra más espaciosa. En 1897 se formó un comité de construcción encabezado por el sacerdote Mitrofan Panov, y el 12 de septiembre de 1899 se colocó la primera piedra del nuevo templo en un lugar más alto, en la orilla opuesta del río Nepolod.

Hasta nuestros días se han conservado los nombres de algunos de los constructores del templo: el maestro de ladrillos Marinichev, los carpinteros Gorlin, Mishin, Shinariev, Iván Starcev, el maestro del iconostasio Goncharenko y otros. Los trabajos de construcción fueron realizados por el contratista Levakov con los capataces Shirkov y Chekrygin y sus brigadas. La supervisión arquitectónica fue llevada a cabo por el arquitecto Pukhalsky durante la colocación de los cimientos y el arquitecto diocesano Vilfort en las etapas posteriores. La construcción se financió con fondos locales y donaciones, y los campesinos participaron en la construcción realizando trabajos de transporte y por jornada.

El 4 de enero de 1909, el templo de una sola altar en honor a San Nicolás fue consagrado. La campanario de tres niveles solo se completó hasta la mitad del segundo nivel en 1910, y quedó sin terminar. Fue reemplazada por una campanario de madera sobre pilares, ubicada junto al templo.

Los servicios en la antigua iglesia de madera de San Nicolás cesaron en 1909. El 12 de abril de 1921, el iconostasio fue desmontado y trasladado al pueblo de Serenk, en el distrito de Volkhov, y parte de los íconos se entregaron a la nueva iglesia de San Nicolás. Ese mismo año, el encargado del museo de la provincia de Orlov, P. S. Tkachevsky, inspeccionó la iglesia y realizó varios bocetos, después de lo cual fue desmantelada para la construcción de una escuela, y las puertas reales del siglo XVIII que se conservaron fueron entregadas al museo provincial, pero no se han preservado.

La iglesia de piedra de San Nicolás fue cerrada en 1940, después de lo cual perdió el nivel superior inacabado del campanario y todas sus cúpulas, excepto la central. En 1991, la iglesia fue entregada a la comunidad de creyentes, y tras su restauración, desde el otoño de 1995 volvió a estar en funcionamiento.