La comunidad ortodoxa rusa fue fundada en Australia Occidental en 1950 por el padre Afanasiy (Mogilev), quien llegó al estado para el servicio pastoral en el campamento de inmigrantes Northam. Poco después, Sergey Putilin fundó una nueva parroquia en Perth. Inicialmente, los servicios se celebraban en un salón de la iglesia anglicana, pero ya el 25 de mayo de 1953 se llevó a cabo la ceremonia de colocación de la piedra angular. El 14 de octubre de 1954, en la festividad de la Protección de la Santísima Virgen, el Obispo Feodor consagró solemnemente la primera iglesia de San Pedro y San Pablo en Perth. También participó en la consagración el sacerdote de la comunidad ortodoxa serbia, padre Petr Radosh, quien desde 1969 hasta 1990 atendió espiritualmente a la parroquia e inspiró la construcción de una nueva iglesia de ladrillo.

La nueva iglesia de San Pedro y San Pablo fue construida en el lugar de la antigua en 1990, según el diseño del arquitecto Alexey Somov, en el estilo de las tradicionales iglesias de Pskov de Rusia, y fue consagrada por el Arzobispo Pavel en el primer domingo después de la festividad de Todos los Santos.

Actualmente, los servicios en la iglesia son dirigidos por el protoiereo Sergey Okunev, quien desde el 27 de junio de 1997 es el rector de la parroquia. La iglesia está abierta principalmente los domingos, durante los servicios y en festividades. La celebración de sacramentos ortodoxos adicionales se lleva a cabo previa cita.