La iglesia de los santos Zacarías y Elisabet es la primera construcción de piedra del monasterio de la Santísima Trinidad de Klimenitsy y, probablemente, la edificación de piedra más antigua de la isla de Gran Klimenitsy. Construida en 1757 con fondos donados por la emperatriz Isabel Petrovna, la iglesia fue probablemente erigida por un grupo de maestros campesinos que no estaban familiarizados con el estilo barroco popular en ese momento. La arquitectura del edificio es simple y arcaica: es un cuadrado con un vestíbulo y un ábside cuadrado, con un techo a cuatro aguas coronado por una cúpula. La decoración exterior es mínima e incluye pilastras en las paredes laterales y un ladrillo en ángulo en el ábside.

En 1840, la iglesia fue ligeramente remodelada, y en 1906 sufrió un incendio, pero a diferencia de la mayoría de los otros edificios del monasterio, sobrevivió. En la década de 1920, la iglesia fue cerrada junto con el monasterio, y en la época de posguerra se utilizó para alojar al personal de un campamento de pioneros que se estableció en los antiguos edificios del monasterio.

Hoy, tras el cierre del campamento, el territorio del santuario de Klimenitsy está abandonado. La iglesia de Zacarías y Elisabet, según datos no confirmados, a veces se utiliza como vivienda. El segundo piso está parcialmente acristalado y aislado, se ha instalado una estufa con chimenea a través de la cúpula. La parte inferior de la iglesia se encuentra en un estado más lamentable. En el suelo a la entrada se ha equipado un pozo de hielo, donde se han encontrado restos humanos, enterrados tras la destrucción del cementerio del monasterio en los años soviéticos. La sala principal del templo ha sido parcialmente despejada de escombros, incluyendo el suelo del lado izquierdo del coro, donde, según la tradición, descansan las reliquias del fundador del monasterio, Jonás Klimenitsy. En las paredes del altar se han conservado fragmentos de frescos que intentaron ser destruidos durante la remodelación del edificio; hoy se están deteriorando debido a la humedad y la falta de acristalamiento. El estado del edificio genera preocupaciones: el ladrillo se está descomponiendo, la yesería falta y las bóvedas sin techo están cerca del colapso.