La ceremonia solemne de la colocación de la iglesia en Balakovo tuvo lugar el 28 de julio de 1909. La construcción comenzó en 1910 y se completó en el otoño de 1912, cuando en octubre se levantaron 17 campanas. Según los historiadores locales, la construcción fue dirigida por el ingeniero Antonov, que trabajó bajo la supervisión del arquitecto Fyodor Shekhtel. Durante 1912 y 1913, Shekhtel se ocupó del acabado exterior de la iglesia.

El arquitecto Shekhtel eligió el sitio de construcción en la alta orilla del río Balakovka, para que la iglesia fuera visible desde el Volga y cerrara la perspectiva de la Plaza Ambar. Durante la crecida, los vapores y las barcazas de carga llegaban al muelle de pan de Balakovo, adyacente a la plaza. La iglesia se convirtió en la dominante de la plaza y dejó una impresión favorable en los visitantes de Balakovo.

Después de la transferencia del edificio a las autoridades estatales, el presidente del consejo municipal A. Karpukhin envió en 1930 una consulta a Leningrado sobre el valor del edificio. De la carta del director del CGRM I. Grabar se desprendía que el edificio no era un monumento arquitectónico y no estaba protegido por el estado, pero la pintura de íconos representaba un valor especial como monumento del arte monumental y estaba bajo la gestión de Glavscience.

En 1930, al mismo tiempo que se destruían todas las iglesias de la ciudad, se destruyeron las cúpulas del volumen central y el campanario de la iglesia de la Trinidad. Se desmantelaron la campana superior, las ábsides y la barrera del altar. Desde el segundo nivel del campanario se arrojó la famosa campana, que se rompió, y sus fragmentos fueron recogidos por la policía y llevados. Se conserva un acta de inspección del edificio de la iglesia de Belokrinitskaya de 1930, en la que se indica que el edificio debe adaptarse para un teatro urbano. No se sabe nada sobre el destino de los valiosos íconos antiguos rusos adquiridos por A. Maltsev. El teatro recibió el nombre de Chapayev, y el edificio fue gravemente mutilado, convirtiendo el altar en un escenario.

En 1989, el edificio fue oficialmente transferido a la Iglesia Ortodoxa Rusa, y comenzó la activa restauración de la iglesia bajo la dirección del padre Anatoly Shumov, quien dedicó todas sus fuerzas a esta causa. Muchas personas participaron en la restauración: la administración de la ciudad, especialistas y líderes de diversas organizaciones y empresas, arquitectos, constructores, artistas y feligreses. El proceso de restauración fue complicado y estuvo relacionado con muchos problemas. Cada habitación, estructura y material requería decisiones precisas.

En 1996 se restauró la cúpula con el remate y la cruz, y luego el campanario. Se realizó una inspección técnica de las estructuras portantes de la cúpula central y se detectó una ruptura en la atadura de la base del tambor. El peso de la cúpula con la cúpula interna era de 220 toneladas, y la restauración posterior era imposible sin garantizar la capacidad portante necesaria de las estructuras. El proyecto de D. Golubinov no resolvía este problema, por lo que se contrataron a los especialistas V. A. Aridov y A. A. Zemlyansky, quienes desarrollaron cálculos y dibujos para garantizar la capacidad portante del anillo de soporte del tambor. También se tuvieron en cuenta las propuestas del proyecto de Lilia Veselova.

Queda mucho trabajo por hacer antes de la finalización completa, incluyendo la ejecución del iconostasio, la pintura de la iglesia según los bocetos del autor y la fabricación de muebles. Sin embargo, ya se puede decir que la reconstrucción se acerca a la idea del gran arquitecto Shekhtel. La iglesia, como un fénix, resurge de las cenizas.