La historia de la creación de la iglesia comienza en 1740, cuando el noble ruso y navegante Alexei Chirikov donó una tienda de campaña de iglesia para el asentamiento de Avachinsk, consagrada en nombre del Nacimiento de la Santísima Virgen.

Más tarde, la iglesia fue trasladada de la tienda a un edificio de madera más sólido. Con el tiempo, muchos habitantes abandonaron el asentamiento, y se decidió mover la iglesia cerca del río Paratunka.

En 1810, la iglesia fue nuevamente consagrada, pero ya en honor a los santos Pedro y Pablo. Cuatro años después, se añadió una capilla al edificio, dedicada a la Santísima Virgen.

Debido al uso de materiales de baja calidad y a las condiciones climáticas desfavorables, el edificio pronto se volvió inadecuado para los servicios. Se construyó una nueva iglesia para 1826, pero estaba en constante reconstrucción. Lo único que permanecía inalterado era su ubicación. En 1834, la fachada del edificio fue cubierta de hierro, y se construyeron varias casas para el clero.

Con la llegada del poder soviético, la iglesia y sus bienes fueron nacionalizados, y el edificio cerrado. Más tarde, fue utilizado como cine. A mediados del siglo, la iglesia fue demolida, descubriendo un escondite con un antiguo Evangelio en un estuche dorado.

En 1992, se construyó una nueva iglesia de Pedro y Pablo en estilo moderno en Petropávlovsk-Kamchatski.